Protein–RNA interactions for Protein: B1AV60

Nhs, NHS actin-remodeling regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,647 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NhsB1AV60 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NhsB1AV60 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NhsB1AV60 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NhsB1AV60 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NhsB1AV60 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NhsB1AV60 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NhsB1AV60 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NhsB1AV60 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NhsB1AV60 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NhsB1AV60 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NhsB1AV60 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NhsB1AV60 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NhsB1AV60 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NhsB1AV60 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NhsB1AV60 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NhsB1AV60 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NhsB1AV60 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NhsB1AV60 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NhsB1AV60 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NhsB1AV60 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NhsB1AV60 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NhsB1AV60 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NhsB1AV60 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NhsB1AV60 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NhsB1AV60 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NhsB1AV60 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NhsB1AV60 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NhsB1AV60 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NhsB1AV60 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NhsB1AV60 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
NhsB1AV60 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NhsB1AV60 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NhsB1AV60 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NhsB1AV60 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NhsB1AV60 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NhsB1AV60 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NhsB1AV60 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NhsB1AV60 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NhsB1AV60 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NhsB1AV60 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NhsB1AV60 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NhsB1AV60 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NhsB1AV60 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NhsB1AV60 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NhsB1AV60 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NhsB1AV60 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NhsB1AV60 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NhsB1AV60 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NhsB1AV60 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NhsB1AV60 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NhsB1AV60 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NhsB1AV60 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NhsB1AV60 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NhsB1AV60 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NhsB1AV60 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NhsB1AV60 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NhsB1AV60 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NhsB1AV60 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NhsB1AV60 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NhsB1AV60 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NhsB1AV60 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NhsB1AV60 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NhsB1AV60 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NhsB1AV60 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NhsB1AV60 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NhsB1AV60 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NhsB1AV60 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NhsB1AV60 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NhsB1AV60 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NhsB1AV60 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NhsB1AV60 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NhsB1AV60 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NhsB1AV60 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NhsB1AV60 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NhsB1AV60 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NhsB1AV60 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NhsB1AV60 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NhsB1AV60 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NhsB1AV60 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NhsB1AV60 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NhsB1AV60 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NhsB1AV60 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NhsB1AV60 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NhsB1AV60 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NhsB1AV60 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NhsB1AV60 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NhsB1AV60 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NhsB1AV60 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NhsB1AV60 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NhsB1AV60 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NhsB1AV60 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NhsB1AV60 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NhsB1AV60 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NhsB1AV60 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NhsB1AV60 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NhsB1AV60 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NhsB1AV60 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NhsB1AV60 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NhsB1AV60 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NhsB1AV60 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms