Protein–RNA interactions for Protein: A9JSM3

Tmem238, Transmembrane protein 238, mousemouse

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Length 176 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem238A9JSM3 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
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