Protein–RNA interactions for Protein: A7TZF3

Skint4, Selection and upkeep of intraepithelial T-cells protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skint4A7TZF3 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Skint4A7TZF3 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Skint4A7TZF3 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Skint4A7TZF3 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Skint4A7TZF3 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Skint4A7TZF3 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Skint4A7TZF3 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Skint4A7TZF3 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Skint4A7TZF3 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Skint4A7TZF3 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Skint4A7TZF3 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Skint4A7TZF3 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Skint4A7TZF3 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
Skint4A7TZF3 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Skint4A7TZF3 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Skint4A7TZF3 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Skint4A7TZF3 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Skint4A7TZF3 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Skint4A7TZF3 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Skint4A7TZF3 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Skint4A7TZF3 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Skint4A7TZF3 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Skint4A7TZF3 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Skint4A7TZF3 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Skint4A7TZF3 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Skint4A7TZF3 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Skint4A7TZF3 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Skint4A7TZF3 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Skint4A7TZF3 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Skint4A7TZF3 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Skint4A7TZF3 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Skint4A7TZF3 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Skint4A7TZF3 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Skint4A7TZF3 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Skint4A7TZF3 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Skint4A7TZF3 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Skint4A7TZF3 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Skint4A7TZF3 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Skint4A7TZF3 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Skint4A7TZF3 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Skint4A7TZF3 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Skint4A7TZF3 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Skint4A7TZF3 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Skint4A7TZF3 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Skint4A7TZF3 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Skint4A7TZF3 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Skint4A7TZF3 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Skint4A7TZF3 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Skint4A7TZF3 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Skint4A7TZF3 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Skint4A7TZF3 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Skint4A7TZF3 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Skint4A7TZF3 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Skint4A7TZF3 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Skint4A7TZF3 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Skint4A7TZF3 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Skint4A7TZF3 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Skint4A7TZF3 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Skint4A7TZF3 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Skint4A7TZF3 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Skint4A7TZF3 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Skint4A7TZF3 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Skint4A7TZF3 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Skint4A7TZF3 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Skint4A7TZF3 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Skint4A7TZF3 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Skint4A7TZF3 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Skint4A7TZF3 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Skint4A7TZF3 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Skint4A7TZF3 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Skint4A7TZF3 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Skint4A7TZF3 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Skint4A7TZF3 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Skint4A7TZF3 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Skint4A7TZF3 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Skint4A7TZF3 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Skint4A7TZF3 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Skint4A7TZF3 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Skint4A7TZF3 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Skint4A7TZF3 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Skint4A7TZF3 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Skint4A7TZF3 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Skint4A7TZF3 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Skint4A7TZF3 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Skint4A7TZF3 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Skint4A7TZF3 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Skint4A7TZF3 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Skint4A7TZF3 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Skint4A7TZF3 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Skint4A7TZF3 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Skint4A7TZF3 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Skint4A7TZF3 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Skint4A7TZF3 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Skint4A7TZF3 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Skint4A7TZF3 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Skint4A7TZF3 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Skint4A7TZF3 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Skint4A7TZF3 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Skint4A7TZF3 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Skint4A7TZF3 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms