Protein–RNA interactions for Protein: A3KG49

Gm5640, Predicted gene 5640, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5640A3KG49 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5640A3KG49 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5640A3KG49 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5640A3KG49 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5640A3KG49 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5640A3KG49 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5640A3KG49 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5640A3KG49 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5640A3KG49 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5640A3KG49 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5640A3KG49 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5640A3KG49 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5640A3KG49 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5640A3KG49 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5640A3KG49 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5640A3KG49 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5640A3KG49 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5640A3KG49 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5640A3KG49 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5640A3KG49 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5640A3KG49 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5640A3KG49 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5640A3KG49 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5640A3KG49 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5640A3KG49 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5640A3KG49 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5640A3KG49 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5640A3KG49 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5640A3KG49 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5640A3KG49 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5640A3KG49 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5640A3KG49 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5640A3KG49 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5640A3KG49 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5640A3KG49 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5640A3KG49 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5640A3KG49 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5640A3KG49 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5640A3KG49 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5640A3KG49 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5640A3KG49 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5640A3KG49 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5640A3KG49 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5640A3KG49 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5640A3KG49 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5640A3KG49 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5640A3KG49 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5640A3KG49 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5640A3KG49 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5640A3KG49 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5640A3KG49 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5640A3KG49 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5640A3KG49 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5640A3KG49 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5640A3KG49 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5640A3KG49 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5640A3KG49 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5640A3KG49 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5640A3KG49 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5640A3KG49 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5640A3KG49 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5640A3KG49 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5640A3KG49 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5640A3KG49 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5640A3KG49 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5640A3KG49 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5640A3KG49 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5640A3KG49 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5640A3KG49 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5640A3KG49 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5640A3KG49 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5640A3KG49 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5640A3KG49 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5640A3KG49 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5640A3KG49 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5640A3KG49 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5640A3KG49 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5640A3KG49 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5640A3KG49 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5640A3KG49 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5640A3KG49 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5640A3KG49 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5640A3KG49 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5640A3KG49 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5640A3KG49 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5640A3KG49 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5640A3KG49 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5640A3KG49 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5640A3KG49 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5640A3KG49 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5640A3KG49 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5640A3KG49 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5640A3KG49 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5640A3KG49 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5640A3KG49 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5640A3KG49 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5640A3KG49 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5640A3KG49 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5640A3KG49 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5640A3KG49 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms