Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI5

Scn3a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn3aA2ASI5 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Scn3aA2ASI5 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Scn3aA2ASI5 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Scn3aA2ASI5 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Scn3aA2ASI5 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Scn3aA2ASI5 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Scn3aA2ASI5 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Scn3aA2ASI5 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Scn3aA2ASI5 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Scn3aA2ASI5 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Scn3aA2ASI5 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Scn3aA2ASI5 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Scn3aA2ASI5 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Scn3aA2ASI5 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Scn3aA2ASI5 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Scn3aA2ASI5 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Scn3aA2ASI5 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Scn3aA2ASI5 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Scn3aA2ASI5 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Scn3aA2ASI5 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Scn3aA2ASI5 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Scn3aA2ASI5 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Scn3aA2ASI5 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Scn3aA2ASI5 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Scn3aA2ASI5 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Scn3aA2ASI5 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Scn3aA2ASI5 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Scn3aA2ASI5 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Scn3aA2ASI5 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Scn3aA2ASI5 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Scn3aA2ASI5 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Scn3aA2ASI5 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scn3aA2ASI5 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scn3aA2ASI5 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Scn3aA2ASI5 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scn3aA2ASI5 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Scn3aA2ASI5 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scn3aA2ASI5 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scn3aA2ASI5 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scn3aA2ASI5 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scn3aA2ASI5 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scn3aA2ASI5 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scn3aA2ASI5 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scn3aA2ASI5 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scn3aA2ASI5 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scn3aA2ASI5 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scn3aA2ASI5 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scn3aA2ASI5 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scn3aA2ASI5 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scn3aA2ASI5 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scn3aA2ASI5 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scn3aA2ASI5 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scn3aA2ASI5 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scn3aA2ASI5 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scn3aA2ASI5 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scn3aA2ASI5 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Scn3aA2ASI5 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scn3aA2ASI5 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scn3aA2ASI5 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scn3aA2ASI5 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scn3aA2ASI5 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scn3aA2ASI5 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scn3aA2ASI5 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scn3aA2ASI5 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scn3aA2ASI5 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scn3aA2ASI5 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scn3aA2ASI5 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scn3aA2ASI5 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scn3aA2ASI5 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scn3aA2ASI5 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scn3aA2ASI5 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scn3aA2ASI5 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scn3aA2ASI5 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scn3aA2ASI5 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scn3aA2ASI5 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scn3aA2ASI5 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scn3aA2ASI5 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scn3aA2ASI5 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scn3aA2ASI5 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scn3aA2ASI5 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scn3aA2ASI5 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scn3aA2ASI5 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scn3aA2ASI5 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scn3aA2ASI5 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scn3aA2ASI5 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scn3aA2ASI5 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scn3aA2ASI5 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scn3aA2ASI5 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scn3aA2ASI5 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scn3aA2ASI5 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scn3aA2ASI5 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scn3aA2ASI5 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scn3aA2ASI5 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scn3aA2ASI5 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scn3aA2ASI5 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scn3aA2ASI5 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scn3aA2ASI5 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scn3aA2ASI5 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scn3aA2ASI5 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scn3aA2ASI5 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms