Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rtf1A2AQ19 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rtf1A2AQ19 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rtf1A2AQ19 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rtf1A2AQ19 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rtf1A2AQ19 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rtf1A2AQ19 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rtf1A2AQ19 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rtf1A2AQ19 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rtf1A2AQ19 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rtf1A2AQ19 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rtf1A2AQ19 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Rtf1A2AQ19 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rtf1A2AQ19 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rtf1A2AQ19 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Rtf1A2AQ19 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rtf1A2AQ19 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rtf1A2AQ19 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Rtf1A2AQ19 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rtf1A2AQ19 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rtf1A2AQ19 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rtf1A2AQ19 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rtf1A2AQ19 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rtf1A2AQ19 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rtf1A2AQ19 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rtf1A2AQ19 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rtf1A2AQ19 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rtf1A2AQ19 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rtf1A2AQ19 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rtf1A2AQ19 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rtf1A2AQ19 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rtf1A2AQ19 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rtf1A2AQ19 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rtf1A2AQ19 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rtf1A2AQ19 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rtf1A2AQ19 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rtf1A2AQ19 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Rtf1A2AQ19 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rtf1A2AQ19 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rtf1A2AQ19 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rtf1A2AQ19 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rtf1A2AQ19 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rtf1A2AQ19 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rtf1A2AQ19 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rtf1A2AQ19 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rtf1A2AQ19 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rtf1A2AQ19 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rtf1A2AQ19 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rtf1A2AQ19 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Rtf1A2AQ19 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rtf1A2AQ19 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Rtf1A2AQ19 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rtf1A2AQ19 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rtf1A2AQ19 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rtf1A2AQ19 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rtf1A2AQ19 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rtf1A2AQ19 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rtf1A2AQ19 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rtf1A2AQ19 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rtf1A2AQ19 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Rtf1A2AQ19 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Rtf1A2AQ19 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Rtf1A2AQ19 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rtf1A2AQ19 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rtf1A2AQ19 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rtf1A2AQ19 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rtf1A2AQ19 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rtf1A2AQ19 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rtf1A2AQ19 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rtf1A2AQ19 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rtf1A2AQ19 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rtf1A2AQ19 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rtf1A2AQ19 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rtf1A2AQ19 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rtf1A2AQ19 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rtf1A2AQ19 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rtf1A2AQ19 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rtf1A2AQ19 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rtf1A2AQ19 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rtf1A2AQ19 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rtf1A2AQ19 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rtf1A2AQ19 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rtf1A2AQ19 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rtf1A2AQ19 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rtf1A2AQ19 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rtf1A2AQ19 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rtf1A2AQ19 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rtf1A2AQ19 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rtf1A2AQ19 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rtf1A2AQ19 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rtf1A2AQ19 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rtf1A2AQ19 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rtf1A2AQ19 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rtf1A2AQ19 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rtf1A2AQ19 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rtf1A2AQ19 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rtf1A2AQ19 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rtf1A2AQ19 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rtf1A2AQ19 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rtf1A2AQ19 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
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