Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syndig1A2ANU3 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syndig1A2ANU3 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syndig1A2ANU3 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syndig1A2ANU3 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syndig1A2ANU3 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syndig1A2ANU3 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Syndig1A2ANU3 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syndig1A2ANU3 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syndig1A2ANU3 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syndig1A2ANU3 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syndig1A2ANU3 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syndig1A2ANU3 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Syndig1A2ANU3 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syndig1A2ANU3 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syndig1A2ANU3 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syndig1A2ANU3 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Syndig1A2ANU3 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syndig1A2ANU3 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syndig1A2ANU3 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syndig1A2ANU3 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Syndig1A2ANU3 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syndig1A2ANU3 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syndig1A2ANU3 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syndig1A2ANU3 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syndig1A2ANU3 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syndig1A2ANU3 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syndig1A2ANU3 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syndig1A2ANU3 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syndig1A2ANU3 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syndig1A2ANU3 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syndig1A2ANU3 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syndig1A2ANU3 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syndig1A2ANU3 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syndig1A2ANU3 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syndig1A2ANU3 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syndig1A2ANU3 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syndig1A2ANU3 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syndig1A2ANU3 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syndig1A2ANU3 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syndig1A2ANU3 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Syndig1A2ANU3 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syndig1A2ANU3 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syndig1A2ANU3 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syndig1A2ANU3 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Syndig1A2ANU3 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syndig1A2ANU3 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syndig1A2ANU3 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syndig1A2ANU3 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syndig1A2ANU3 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syndig1A2ANU3 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Syndig1A2ANU3 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Syndig1A2ANU3 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Syndig1A2ANU3 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Syndig1A2ANU3 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Syndig1A2ANU3 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Syndig1A2ANU3 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Syndig1A2ANU3 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Syndig1A2ANU3 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Syndig1A2ANU3 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Syndig1A2ANU3 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Syndig1A2ANU3 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Syndig1A2ANU3 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Syndig1A2ANU3 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Syndig1A2ANU3 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Syndig1A2ANU3 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Syndig1A2ANU3 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Syndig1A2ANU3 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Syndig1A2ANU3 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Syndig1A2ANU3 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Syndig1A2ANU3 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Syndig1A2ANU3 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Syndig1A2ANU3 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Syndig1A2ANU3 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Syndig1A2ANU3 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Syndig1A2ANU3 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Syndig1A2ANU3 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Syndig1A2ANU3 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Syndig1A2ANU3 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Syndig1A2ANU3 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Syndig1A2ANU3 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Syndig1A2ANU3 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Syndig1A2ANU3 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syndig1A2ANU3 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syndig1A2ANU3 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syndig1A2ANU3 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syndig1A2ANU3 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syndig1A2ANU3 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syndig1A2ANU3 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Syndig1A2ANU3 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syndig1A2ANU3 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Syndig1A2ANU3 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Syndig1A2ANU3 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Syndig1A2ANU3 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syndig1A2ANU3 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Syndig1A2ANU3 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Syndig1A2ANU3 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Syndig1A2ANU3 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syndig1A2ANU3 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syndig1A2ANU3 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms