Protein–RNA interactions for Protein: A2AM80

Fam43b, Family with sequence similarity 43, member B, mousemouse

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Length 330 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam43bA2AM80 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam43bA2AM80 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam43bA2AM80 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam43bA2AM80 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam43bA2AM80 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam43bA2AM80 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam43bA2AM80 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam43bA2AM80 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam43bA2AM80 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam43bA2AM80 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam43bA2AM80 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam43bA2AM80 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam43bA2AM80 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam43bA2AM80 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam43bA2AM80 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam43bA2AM80 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam43bA2AM80 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam43bA2AM80 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam43bA2AM80 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam43bA2AM80 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam43bA2AM80 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam43bA2AM80 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam43bA2AM80 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam43bA2AM80 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam43bA2AM80 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam43bA2AM80 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam43bA2AM80 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam43bA2AM80 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam43bA2AM80 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam43bA2AM80 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam43bA2AM80 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam43bA2AM80 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam43bA2AM80 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam43bA2AM80 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam43bA2AM80 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam43bA2AM80 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam43bA2AM80 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam43bA2AM80 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam43bA2AM80 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam43bA2AM80 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam43bA2AM80 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam43bA2AM80 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam43bA2AM80 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam43bA2AM80 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam43bA2AM80 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam43bA2AM80 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam43bA2AM80 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam43bA2AM80 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam43bA2AM80 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam43bA2AM80 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam43bA2AM80 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam43bA2AM80 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam43bA2AM80 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam43bA2AM80 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam43bA2AM80 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam43bA2AM80 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam43bA2AM80 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam43bA2AM80 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam43bA2AM80 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam43bA2AM80 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam43bA2AM80 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam43bA2AM80 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam43bA2AM80 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam43bA2AM80 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam43bA2AM80 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam43bA2AM80 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam43bA2AM80 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam43bA2AM80 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam43bA2AM80 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam43bA2AM80 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam43bA2AM80 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam43bA2AM80 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam43bA2AM80 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam43bA2AM80 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam43bA2AM80 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam43bA2AM80 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam43bA2AM80 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam43bA2AM80 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam43bA2AM80 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam43bA2AM80 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam43bA2AM80 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam43bA2AM80 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam43bA2AM80 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam43bA2AM80 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam43bA2AM80 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam43bA2AM80 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam43bA2AM80 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam43bA2AM80 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam43bA2AM80 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam43bA2AM80 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam43bA2AM80 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam43bA2AM80 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam43bA2AM80 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam43bA2AM80 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam43bA2AM80 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam43bA2AM80 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam43bA2AM80 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam43bA2AM80 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam43bA2AM80 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam43bA2AM80 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.7 ms