Protein–RNA interactions for Protein: A2AKB4

Frmpd1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd1A2AKB4 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Frmpd1A2AKB4 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Frmpd1A2AKB4 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Frmpd1A2AKB4 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Frmpd1A2AKB4 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Frmpd1A2AKB4 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Frmpd1A2AKB4 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Frmpd1A2AKB4 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Frmpd1A2AKB4 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Frmpd1A2AKB4 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Frmpd1A2AKB4 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Frmpd1A2AKB4 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Frmpd1A2AKB4 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Frmpd1A2AKB4 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Frmpd1A2AKB4 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Frmpd1A2AKB4 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Frmpd1A2AKB4 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Frmpd1A2AKB4 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Frmpd1A2AKB4 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Frmpd1A2AKB4 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Frmpd1A2AKB4 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Frmpd1A2AKB4 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Frmpd1A2AKB4 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Frmpd1A2AKB4 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Frmpd1A2AKB4 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Frmpd1A2AKB4 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Frmpd1A2AKB4 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Frmpd1A2AKB4 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Frmpd1A2AKB4 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Frmpd1A2AKB4 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Frmpd1A2AKB4 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Frmpd1A2AKB4 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Frmpd1A2AKB4 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Frmpd1A2AKB4 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Frmpd1A2AKB4 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Frmpd1A2AKB4 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Frmpd1A2AKB4 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Frmpd1A2AKB4 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Frmpd1A2AKB4 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Frmpd1A2AKB4 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Frmpd1A2AKB4 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Frmpd1A2AKB4 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Frmpd1A2AKB4 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Frmpd1A2AKB4 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Frmpd1A2AKB4 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Frmpd1A2AKB4 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Frmpd1A2AKB4 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Frmpd1A2AKB4 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Frmpd1A2AKB4 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Frmpd1A2AKB4 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Frmpd1A2AKB4 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Frmpd1A2AKB4 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Frmpd1A2AKB4 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Frmpd1A2AKB4 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Frmpd1A2AKB4 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Frmpd1A2AKB4 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Frmpd1A2AKB4 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Frmpd1A2AKB4 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Frmpd1A2AKB4 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Frmpd1A2AKB4 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Frmpd1A2AKB4 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Frmpd1A2AKB4 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Frmpd1A2AKB4 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Frmpd1A2AKB4 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Frmpd1A2AKB4 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Frmpd1A2AKB4 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Frmpd1A2AKB4 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Frmpd1A2AKB4 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Frmpd1A2AKB4 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Frmpd1A2AKB4 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Frmpd1A2AKB4 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Frmpd1A2AKB4 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Frmpd1A2AKB4 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Frmpd1A2AKB4 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Frmpd1A2AKB4 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Frmpd1A2AKB4 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Frmpd1A2AKB4 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Frmpd1A2AKB4 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Frmpd1A2AKB4 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Frmpd1A2AKB4 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Frmpd1A2AKB4 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Frmpd1A2AKB4 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Frmpd1A2AKB4 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Frmpd1A2AKB4 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Frmpd1A2AKB4 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Frmpd1A2AKB4 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Frmpd1A2AKB4 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Frmpd1A2AKB4 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Frmpd1A2AKB4 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Frmpd1A2AKB4 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Frmpd1A2AKB4 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Frmpd1A2AKB4 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Frmpd1A2AKB4 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Frmpd1A2AKB4 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Frmpd1A2AKB4 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Frmpd1A2AKB4 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Frmpd1A2AKB4 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Frmpd1A2AKB4 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Frmpd1A2AKB4 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Frmpd1A2AKB4 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms