Protein–RNA interactions for Protein: A2AGD7

Ccdc163, Coiled-coil domain-containing 163, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc163A2AGD7 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc163A2AGD7 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc163A2AGD7 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc163A2AGD7 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc163A2AGD7 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc163A2AGD7 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc163A2AGD7 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc163A2AGD7 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc163A2AGD7 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc163A2AGD7 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc163A2AGD7 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc163A2AGD7 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc163A2AGD7 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc163A2AGD7 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc163A2AGD7 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc163A2AGD7 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc163A2AGD7 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc163A2AGD7 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc163A2AGD7 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc163A2AGD7 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc163A2AGD7 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc163A2AGD7 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc163A2AGD7 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc163A2AGD7 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc163A2AGD7 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc163A2AGD7 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc163A2AGD7 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc163A2AGD7 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc163A2AGD7 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc163A2AGD7 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc163A2AGD7 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc163A2AGD7 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc163A2AGD7 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc163A2AGD7 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc163A2AGD7 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc163A2AGD7 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc163A2AGD7 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc163A2AGD7 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc163A2AGD7 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc163A2AGD7 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc163A2AGD7 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc163A2AGD7 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc163A2AGD7 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc163A2AGD7 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc163A2AGD7 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc163A2AGD7 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc163A2AGD7 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc163A2AGD7 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc163A2AGD7 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc163A2AGD7 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc163A2AGD7 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc163A2AGD7 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc163A2AGD7 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc163A2AGD7 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc163A2AGD7 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc163A2AGD7 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc163A2AGD7 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc163A2AGD7 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc163A2AGD7 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc163A2AGD7 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc163A2AGD7 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc163A2AGD7 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc163A2AGD7 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc163A2AGD7 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc163A2AGD7 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc163A2AGD7 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc163A2AGD7 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc163A2AGD7 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc163A2AGD7 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc163A2AGD7 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc163A2AGD7 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc163A2AGD7 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc163A2AGD7 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc163A2AGD7 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc163A2AGD7 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc163A2AGD7 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc163A2AGD7 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc163A2AGD7 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc163A2AGD7 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc163A2AGD7 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc163A2AGD7 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc163A2AGD7 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc163A2AGD7 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc163A2AGD7 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc163A2AGD7 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc163A2AGD7 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc163A2AGD7 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc163A2AGD7 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc163A2AGD7 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc163A2AGD7 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc163A2AGD7 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc163A2AGD7 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc163A2AGD7 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc163A2AGD7 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc163A2AGD7 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc163A2AGD7 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc163A2AGD7 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc163A2AGD7 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc163A2AGD7 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc163A2AGD7 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms