Protein–RNA interactions for Protein: A0N8N6

Trav12-2, T cell receptor alpha variable 12-2 (Fragment), mousemouse

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Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav12-2A0N8N6 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trav12-2A0N8N6 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trav12-2A0N8N6 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trav12-2A0N8N6 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trav12-2A0N8N6 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trav12-2A0N8N6 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trav12-2A0N8N6 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trav12-2A0N8N6 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Trav12-2A0N8N6 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trav12-2A0N8N6 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trav12-2A0N8N6 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Trav12-2A0N8N6 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trav12-2A0N8N6 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Trav12-2A0N8N6 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Trav12-2A0N8N6 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trav12-2A0N8N6 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trav12-2A0N8N6 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trav12-2A0N8N6 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trav12-2A0N8N6 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trav12-2A0N8N6 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trav12-2A0N8N6 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trav12-2A0N8N6 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trav12-2A0N8N6 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trav12-2A0N8N6 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trav12-2A0N8N6 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trav12-2A0N8N6 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trav12-2A0N8N6 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trav12-2A0N8N6 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trav12-2A0N8N6 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trav12-2A0N8N6 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trav12-2A0N8N6 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trav12-2A0N8N6 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trav12-2A0N8N6 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trav12-2A0N8N6 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trav12-2A0N8N6 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trav12-2A0N8N6 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trav12-2A0N8N6 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trav12-2A0N8N6 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trav12-2A0N8N6 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trav12-2A0N8N6 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Trav12-2A0N8N6 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trav12-2A0N8N6 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trav12-2A0N8N6 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trav12-2A0N8N6 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trav12-2A0N8N6 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trav12-2A0N8N6 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trav12-2A0N8N6 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Trav12-2A0N8N6 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trav12-2A0N8N6 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trav12-2A0N8N6 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Trav12-2A0N8N6 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trav12-2A0N8N6 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trav12-2A0N8N6 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Trav12-2A0N8N6 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trav12-2A0N8N6 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trav12-2A0N8N6 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trav12-2A0N8N6 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Trav12-2A0N8N6 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trav12-2A0N8N6 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trav12-2A0N8N6 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trav12-2A0N8N6 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trav12-2A0N8N6 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trav12-2A0N8N6 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trav12-2A0N8N6 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trav12-2A0N8N6 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Trav12-2A0N8N6 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trav12-2A0N8N6 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trav12-2A0N8N6 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Trav12-2A0N8N6 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Trav12-2A0N8N6 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trav12-2A0N8N6 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trav12-2A0N8N6 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trav12-2A0N8N6 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trav12-2A0N8N6 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trav12-2A0N8N6 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trav12-2A0N8N6 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trav12-2A0N8N6 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trav12-2A0N8N6 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trav12-2A0N8N6 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trav12-2A0N8N6 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trav12-2A0N8N6 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trav12-2A0N8N6 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trav12-2A0N8N6 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Trav12-2A0N8N6 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trav12-2A0N8N6 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trav12-2A0N8N6 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trav12-2A0N8N6 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trav12-2A0N8N6 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trav12-2A0N8N6 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trav12-2A0N8N6 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trav12-2A0N8N6 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trav12-2A0N8N6 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trav12-2A0N8N6 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trav12-2A0N8N6 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Trav12-2A0N8N6 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Trav12-2A0N8N6 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Trav12-2A0N8N6 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trav12-2A0N8N6 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trav12-2A0N8N6 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trav12-2A0N8N6 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
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