Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU22

Ptpn4, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 4, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn4Q9WU22 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ptpn4Q9WU22 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ptpn4Q9WU22 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ptpn4Q9WU22 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ptpn4Q9WU22 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ptpn4Q9WU22 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ptpn4Q9WU22 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ptpn4Q9WU22 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ptpn4Q9WU22 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ptpn4Q9WU22 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ptpn4Q9WU22 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ptpn4Q9WU22 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ptpn4Q9WU22 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ptpn4Q9WU22 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ptpn4Q9WU22 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ptpn4Q9WU22 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ptpn4Q9WU22 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ptpn4Q9WU22 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ptpn4Q9WU22 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ptpn4Q9WU22 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ptpn4Q9WU22 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ptpn4Q9WU22 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ptpn4Q9WU22 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ptpn4Q9WU22 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ptpn4Q9WU22 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ptpn4Q9WU22 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ptpn4Q9WU22 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ptpn4Q9WU22 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ptpn4Q9WU22 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ptpn4Q9WU22 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ptpn4Q9WU22 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ptpn4Q9WU22 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Ptpn4Q9WU22 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ptpn4Q9WU22 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ptpn4Q9WU22 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ptpn4Q9WU22 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ptpn4Q9WU22 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ptpn4Q9WU22 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ptpn4Q9WU22 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ptpn4Q9WU22 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ptpn4Q9WU22 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ptpn4Q9WU22 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ptpn4Q9WU22 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ptpn4Q9WU22 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ptpn4Q9WU22 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ptpn4Q9WU22 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ptpn4Q9WU22 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ptpn4Q9WU22 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ptpn4Q9WU22 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ptpn4Q9WU22 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ptpn4Q9WU22 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ptpn4Q9WU22 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ptpn4Q9WU22 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ptpn4Q9WU22 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ptpn4Q9WU22 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ptpn4Q9WU22 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ptpn4Q9WU22 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ptpn4Q9WU22 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ptpn4Q9WU22 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ptpn4Q9WU22 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ptpn4Q9WU22 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ptpn4Q9WU22 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ptpn4Q9WU22 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ptpn4Q9WU22 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ptpn4Q9WU22 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Ptpn4Q9WU22 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ptpn4Q9WU22 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ptpn4Q9WU22 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ptpn4Q9WU22 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ptpn4Q9WU22 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ptpn4Q9WU22 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ptpn4Q9WU22 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ptpn4Q9WU22 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ptpn4Q9WU22 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ptpn4Q9WU22 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ptpn4Q9WU22 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ptpn4Q9WU22 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ptpn4Q9WU22 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ptpn4Q9WU22 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ptpn4Q9WU22 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ptpn4Q9WU22 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ptpn4Q9WU22 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Ptpn4Q9WU22 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ptpn4Q9WU22 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ptpn4Q9WU22 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ptpn4Q9WU22 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ptpn4Q9WU22 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Ptpn4Q9WU22 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ptpn4Q9WU22 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ptpn4Q9WU22 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ptpn4Q9WU22 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ptpn4Q9WU22 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ptpn4Q9WU22 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Ptpn4Q9WU22 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ptpn4Q9WU22 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ptpn4Q9WU22 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ptpn4Q9WU22 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ptpn4Q9WU22 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ptpn4Q9WU22 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ptpn4Q9WU22 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms