Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKE2

Trem1, Triggering receptor expressed on myeloid cells 1, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem1Q9JKE2 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trem1Q9JKE2 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trem1Q9JKE2 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trem1Q9JKE2 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trem1Q9JKE2 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trem1Q9JKE2 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trem1Q9JKE2 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trem1Q9JKE2 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trem1Q9JKE2 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trem1Q9JKE2 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trem1Q9JKE2 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trem1Q9JKE2 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trem1Q9JKE2 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trem1Q9JKE2 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trem1Q9JKE2 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trem1Q9JKE2 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trem1Q9JKE2 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trem1Q9JKE2 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trem1Q9JKE2 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trem1Q9JKE2 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trem1Q9JKE2 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trem1Q9JKE2 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trem1Q9JKE2 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trem1Q9JKE2 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trem1Q9JKE2 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trem1Q9JKE2 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trem1Q9JKE2 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trem1Q9JKE2 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trem1Q9JKE2 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trem1Q9JKE2 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trem1Q9JKE2 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Trem1Q9JKE2 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trem1Q9JKE2 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trem1Q9JKE2 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trem1Q9JKE2 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trem1Q9JKE2 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trem1Q9JKE2 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trem1Q9JKE2 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Trem1Q9JKE2 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trem1Q9JKE2 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Trem1Q9JKE2 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trem1Q9JKE2 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Trem1Q9JKE2 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trem1Q9JKE2 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trem1Q9JKE2 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Trem1Q9JKE2 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trem1Q9JKE2 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trem1Q9JKE2 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Trem1Q9JKE2 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trem1Q9JKE2 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trem1Q9JKE2 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trem1Q9JKE2 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trem1Q9JKE2 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trem1Q9JKE2 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trem1Q9JKE2 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trem1Q9JKE2 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trem1Q9JKE2 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trem1Q9JKE2 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trem1Q9JKE2 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trem1Q9JKE2 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trem1Q9JKE2 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trem1Q9JKE2 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trem1Q9JKE2 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trem1Q9JKE2 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trem1Q9JKE2 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trem1Q9JKE2 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trem1Q9JKE2 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
Trem1Q9JKE2 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trem1Q9JKE2 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trem1Q9JKE2 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trem1Q9JKE2 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trem1Q9JKE2 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trem1Q9JKE2 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trem1Q9JKE2 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trem1Q9JKE2 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trem1Q9JKE2 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trem1Q9JKE2 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trem1Q9JKE2 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trem1Q9JKE2 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trem1Q9JKE2 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trem1Q9JKE2 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trem1Q9JKE2 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trem1Q9JKE2 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trem1Q9JKE2 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trem1Q9JKE2 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Trem1Q9JKE2 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trem1Q9JKE2 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trem1Q9JKE2 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trem1Q9JKE2 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trem1Q9JKE2 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Trem1Q9JKE2 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trem1Q9JKE2 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trem1Q9JKE2 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trem1Q9JKE2 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trem1Q9JKE2 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trem1Q9JKE2 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trem1Q9JKE2 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trem1Q9JKE2 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trem1Q9JKE2 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trem1Q9JKE2 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms