Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK83

Pard6b, Partitioning defective 6 homolog beta, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard6bQ9JK83 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Pard6bQ9JK83 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pard6bQ9JK83 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pard6bQ9JK83 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Pard6bQ9JK83 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pard6bQ9JK83 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pard6bQ9JK83 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pard6bQ9JK83 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pard6bQ9JK83 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pard6bQ9JK83 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Pard6bQ9JK83 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pard6bQ9JK83 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pard6bQ9JK83 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pard6bQ9JK83 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pard6bQ9JK83 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pard6bQ9JK83 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pard6bQ9JK83 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pard6bQ9JK83 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pard6bQ9JK83 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pard6bQ9JK83 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pard6bQ9JK83 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pard6bQ9JK83 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pard6bQ9JK83 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pard6bQ9JK83 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pard6bQ9JK83 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pard6bQ9JK83 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pard6bQ9JK83 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pard6bQ9JK83 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pard6bQ9JK83 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pard6bQ9JK83 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pard6bQ9JK83 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pard6bQ9JK83 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pard6bQ9JK83 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Pard6bQ9JK83 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pard6bQ9JK83 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pard6bQ9JK83 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pard6bQ9JK83 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pard6bQ9JK83 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pard6bQ9JK83 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pard6bQ9JK83 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pard6bQ9JK83 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Pard6bQ9JK83 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pard6bQ9JK83 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Pard6bQ9JK83 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pard6bQ9JK83 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pard6bQ9JK83 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pard6bQ9JK83 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pard6bQ9JK83 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pard6bQ9JK83 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pard6bQ9JK83 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pard6bQ9JK83 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pard6bQ9JK83 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pard6bQ9JK83 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pard6bQ9JK83 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pard6bQ9JK83 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pard6bQ9JK83 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pard6bQ9JK83 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pard6bQ9JK83 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Pard6bQ9JK83 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Pard6bQ9JK83 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Pard6bQ9JK83 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pard6bQ9JK83 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pard6bQ9JK83 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pard6bQ9JK83 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pard6bQ9JK83 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pard6bQ9JK83 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pard6bQ9JK83 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Pard6bQ9JK83 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pard6bQ9JK83 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pard6bQ9JK83 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pard6bQ9JK83 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pard6bQ9JK83 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pard6bQ9JK83 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pard6bQ9JK83 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pard6bQ9JK83 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pard6bQ9JK83 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pard6bQ9JK83 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pard6bQ9JK83 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pard6bQ9JK83 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pard6bQ9JK83 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pard6bQ9JK83 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pard6bQ9JK83 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pard6bQ9JK83 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pard6bQ9JK83 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pard6bQ9JK83 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pard6bQ9JK83 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pard6bQ9JK83 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pard6bQ9JK83 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pard6bQ9JK83 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pard6bQ9JK83 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pard6bQ9JK83 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pard6bQ9JK83 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pard6bQ9JK83 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pard6bQ9JK83 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pard6bQ9JK83 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pard6bQ9JK83 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pard6bQ9JK83 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Pard6bQ9JK83 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pard6bQ9JK83 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pard6bQ9JK83 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms