Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCJ5

Ndufa8, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufa8Q9DCJ5 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ndufa8Q9DCJ5 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ndufa8Q9DCJ5 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Ndufa8Q9DCJ5 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ndufa8Q9DCJ5 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ndufa8Q9DCJ5 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ndufa8Q9DCJ5 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ndufa8Q9DCJ5 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ndufa8Q9DCJ5 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ndufa8Q9DCJ5 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ndufa8Q9DCJ5 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ndufa8Q9DCJ5 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ndufa8Q9DCJ5 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ndufa8Q9DCJ5 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ndufa8Q9DCJ5 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ndufa8Q9DCJ5 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ndufa8Q9DCJ5 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ndufa8Q9DCJ5 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ndufa8Q9DCJ5 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ndufa8Q9DCJ5 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ndufa8Q9DCJ5 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ndufa8Q9DCJ5 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ndufa8Q9DCJ5 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ndufa8Q9DCJ5 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ndufa8Q9DCJ5 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ndufa8Q9DCJ5 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ndufa8Q9DCJ5 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ndufa8Q9DCJ5 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ndufa8Q9DCJ5 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ndufa8Q9DCJ5 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ndufa8Q9DCJ5 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ndufa8Q9DCJ5 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ndufa8Q9DCJ5 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ndufa8Q9DCJ5 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ndufa8Q9DCJ5 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ndufa8Q9DCJ5 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ndufa8Q9DCJ5 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ndufa8Q9DCJ5 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ndufa8Q9DCJ5 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ndufa8Q9DCJ5 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ndufa8Q9DCJ5 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ndufa8Q9DCJ5 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ndufa8Q9DCJ5 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ndufa8Q9DCJ5 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ndufa8Q9DCJ5 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ndufa8Q9DCJ5 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Ndufa8Q9DCJ5 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ndufa8Q9DCJ5 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ndufa8Q9DCJ5 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ndufa8Q9DCJ5 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ndufa8Q9DCJ5 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ndufa8Q9DCJ5 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ndufa8Q9DCJ5 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ndufa8Q9DCJ5 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ndufa8Q9DCJ5 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ndufa8Q9DCJ5 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ndufa8Q9DCJ5 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ndufa8Q9DCJ5 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ndufa8Q9DCJ5 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ndufa8Q9DCJ5 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ndufa8Q9DCJ5 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ndufa8Q9DCJ5 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ndufa8Q9DCJ5 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ndufa8Q9DCJ5 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ndufa8Q9DCJ5 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ndufa8Q9DCJ5 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ndufa8Q9DCJ5 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ndufa8Q9DCJ5 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ndufa8Q9DCJ5 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ndufa8Q9DCJ5 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ndufa8Q9DCJ5 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ndufa8Q9DCJ5 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ndufa8Q9DCJ5 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ndufa8Q9DCJ5 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ndufa8Q9DCJ5 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ndufa8Q9DCJ5 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Ndufa8Q9DCJ5 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ndufa8Q9DCJ5 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ndufa8Q9DCJ5 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ndufa8Q9DCJ5 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ndufa8Q9DCJ5 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ndufa8Q9DCJ5 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Ndufa8Q9DCJ5 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ndufa8Q9DCJ5 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ndufa8Q9DCJ5 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ndufa8Q9DCJ5 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ndufa8Q9DCJ5 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ndufa8Q9DCJ5 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ndufa8Q9DCJ5 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ndufa8Q9DCJ5 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ndufa8Q9DCJ5 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ndufa8Q9DCJ5 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ndufa8Q9DCJ5 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ndufa8Q9DCJ5 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Ndufa8Q9DCJ5 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ndufa8Q9DCJ5 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ndufa8Q9DCJ5 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ndufa8Q9DCJ5 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ndufa8Q9DCJ5 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ndufa8Q9DCJ5 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms