Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBZ1

Ikbip, Inhibitor of nuclear factor kappa-B kinase-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IkbipQ9DBZ1 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IkbipQ9DBZ1 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
IkbipQ9DBZ1 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IkbipQ9DBZ1 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IkbipQ9DBZ1 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IkbipQ9DBZ1 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IkbipQ9DBZ1 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IkbipQ9DBZ1 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IkbipQ9DBZ1 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IkbipQ9DBZ1 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IkbipQ9DBZ1 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IkbipQ9DBZ1 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IkbipQ9DBZ1 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IkbipQ9DBZ1 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IkbipQ9DBZ1 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IkbipQ9DBZ1 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IkbipQ9DBZ1 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IkbipQ9DBZ1 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IkbipQ9DBZ1 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IkbipQ9DBZ1 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IkbipQ9DBZ1 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IkbipQ9DBZ1 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IkbipQ9DBZ1 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
IkbipQ9DBZ1 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IkbipQ9DBZ1 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IkbipQ9DBZ1 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IkbipQ9DBZ1 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IkbipQ9DBZ1 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IkbipQ9DBZ1 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IkbipQ9DBZ1 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IkbipQ9DBZ1 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IkbipQ9DBZ1 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IkbipQ9DBZ1 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IkbipQ9DBZ1 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IkbipQ9DBZ1 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IkbipQ9DBZ1 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IkbipQ9DBZ1 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IkbipQ9DBZ1 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IkbipQ9DBZ1 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IkbipQ9DBZ1 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IkbipQ9DBZ1 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IkbipQ9DBZ1 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IkbipQ9DBZ1 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IkbipQ9DBZ1 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IkbipQ9DBZ1 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IkbipQ9DBZ1 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IkbipQ9DBZ1 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IkbipQ9DBZ1 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IkbipQ9DBZ1 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IkbipQ9DBZ1 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IkbipQ9DBZ1 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IkbipQ9DBZ1 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IkbipQ9DBZ1 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IkbipQ9DBZ1 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IkbipQ9DBZ1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IkbipQ9DBZ1 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IkbipQ9DBZ1 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IkbipQ9DBZ1 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IkbipQ9DBZ1 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IkbipQ9DBZ1 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IkbipQ9DBZ1 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IkbipQ9DBZ1 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IkbipQ9DBZ1 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IkbipQ9DBZ1 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IkbipQ9DBZ1 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
IkbipQ9DBZ1 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
IkbipQ9DBZ1 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IkbipQ9DBZ1 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IkbipQ9DBZ1 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IkbipQ9DBZ1 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IkbipQ9DBZ1 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IkbipQ9DBZ1 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
IkbipQ9DBZ1 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IkbipQ9DBZ1 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IkbipQ9DBZ1 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IkbipQ9DBZ1 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IkbipQ9DBZ1 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IkbipQ9DBZ1 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IkbipQ9DBZ1 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IkbipQ9DBZ1 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IkbipQ9DBZ1 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IkbipQ9DBZ1 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IkbipQ9DBZ1 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IkbipQ9DBZ1 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IkbipQ9DBZ1 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IkbipQ9DBZ1 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IkbipQ9DBZ1 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IkbipQ9DBZ1 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IkbipQ9DBZ1 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IkbipQ9DBZ1 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IkbipQ9DBZ1 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IkbipQ9DBZ1 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IkbipQ9DBZ1 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IkbipQ9DBZ1 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IkbipQ9DBZ1 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IkbipQ9DBZ1 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IkbipQ9DBZ1 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IkbipQ9DBZ1 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IkbipQ9DBZ1 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IkbipQ9DBZ1 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms