Protein–RNA interactions for Protein: Q9D727

Uncharacterized protein C6orf226 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D727 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9D727 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9D727 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9D727 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9D727 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9D727 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9D727 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9D727 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9D727 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9D727 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9D727 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9D727 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9D727 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9D727 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9D727 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9D727 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9D727 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9D727 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9D727 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9D727 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9D727 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9D727 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9D727 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9D727 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9D727 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9D727 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9D727 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9D727 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9D727 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9D727 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9D727 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9D727 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9D727 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9D727 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9D727 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9D727 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9D727 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9D727 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9D727 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9D727 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9D727 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9D727 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9D727 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9D727 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9D727 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9D727 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9D727 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9D727 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9D727 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9D727 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9D727 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9D727 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9D727 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9D727 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9D727 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9D727 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9D727 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9D727 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9D727 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9D727 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9D727 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9D727 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9D727 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9D727 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9D727 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9D727 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q9D727 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q9D727 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q9D727 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q9D727 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9D727 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9D727 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9D727 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9D727 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9D727 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9D727 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9D727 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9D727 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9D727 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9D727 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9D727 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9D727 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9D727 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9D727 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9D727 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9D727 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9D727 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9D727 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9D727 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9D727 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9D727 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9D727 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9D727 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9D727 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9D727 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9D727 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9D727 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9D727 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9D727 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9D727 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 126.2 ms