Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6K8

Fundc2, FUN14 domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fundc2Q9D6K8 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fundc2Q9D6K8 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fundc2Q9D6K8 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fundc2Q9D6K8 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fundc2Q9D6K8 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fundc2Q9D6K8 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fundc2Q9D6K8 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fundc2Q9D6K8 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fundc2Q9D6K8 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fundc2Q9D6K8 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fundc2Q9D6K8 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fundc2Q9D6K8 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fundc2Q9D6K8 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fundc2Q9D6K8 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fundc2Q9D6K8 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fundc2Q9D6K8 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fundc2Q9D6K8 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fundc2Q9D6K8 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fundc2Q9D6K8 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Fundc2Q9D6K8 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Fundc2Q9D6K8 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Fundc2Q9D6K8 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Fundc2Q9D6K8 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Fundc2Q9D6K8 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Fundc2Q9D6K8 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Fundc2Q9D6K8 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Fundc2Q9D6K8 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Fundc2Q9D6K8 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Fundc2Q9D6K8 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Fundc2Q9D6K8 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Fundc2Q9D6K8 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fundc2Q9D6K8 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fundc2Q9D6K8 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fundc2Q9D6K8 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fundc2Q9D6K8 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fundc2Q9D6K8 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fundc2Q9D6K8 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fundc2Q9D6K8 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fundc2Q9D6K8 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fundc2Q9D6K8 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fundc2Q9D6K8 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fundc2Q9D6K8 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fundc2Q9D6K8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fundc2Q9D6K8 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fundc2Q9D6K8 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fundc2Q9D6K8 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fundc2Q9D6K8 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fundc2Q9D6K8 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fundc2Q9D6K8 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fundc2Q9D6K8 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fundc2Q9D6K8 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fundc2Q9D6K8 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Fundc2Q9D6K8 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Fundc2Q9D6K8 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Fundc2Q9D6K8 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Fundc2Q9D6K8 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Fundc2Q9D6K8 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Fundc2Q9D6K8 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fundc2Q9D6K8 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fundc2Q9D6K8 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fundc2Q9D6K8 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fundc2Q9D6K8 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fundc2Q9D6K8 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fundc2Q9D6K8 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fundc2Q9D6K8 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fundc2Q9D6K8 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fundc2Q9D6K8 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fundc2Q9D6K8 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fundc2Q9D6K8 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fundc2Q9D6K8 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fundc2Q9D6K8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fundc2Q9D6K8 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fundc2Q9D6K8 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fundc2Q9D6K8 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fundc2Q9D6K8 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fundc2Q9D6K8 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fundc2Q9D6K8 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fundc2Q9D6K8 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fundc2Q9D6K8 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fundc2Q9D6K8 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fundc2Q9D6K8 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fundc2Q9D6K8 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fundc2Q9D6K8 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
Fundc2Q9D6K8 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fundc2Q9D6K8 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fundc2Q9D6K8 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fundc2Q9D6K8 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fundc2Q9D6K8 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fundc2Q9D6K8 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Fundc2Q9D6K8 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fundc2Q9D6K8 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fundc2Q9D6K8 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fundc2Q9D6K8 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fundc2Q9D6K8 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fundc2Q9D6K8 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fundc2Q9D6K8 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fundc2Q9D6K8 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fundc2Q9D6K8 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fundc2Q9D6K8 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fundc2Q9D6K8 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms