Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX11

Utp23, rRNA-processing protein UTP23 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp23Q9CX11 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Utp23Q9CX11 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Utp23Q9CX11 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Utp23Q9CX11 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Utp23Q9CX11 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Utp23Q9CX11 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Utp23Q9CX11 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Utp23Q9CX11 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Utp23Q9CX11 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Utp23Q9CX11 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Utp23Q9CX11 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Utp23Q9CX11 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Utp23Q9CX11 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Utp23Q9CX11 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Utp23Q9CX11 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Utp23Q9CX11 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Utp23Q9CX11 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Utp23Q9CX11 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Utp23Q9CX11 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Utp23Q9CX11 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Utp23Q9CX11 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Utp23Q9CX11 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Utp23Q9CX11 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Utp23Q9CX11 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Utp23Q9CX11 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Utp23Q9CX11 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Utp23Q9CX11 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Utp23Q9CX11 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Utp23Q9CX11 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Utp23Q9CX11 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Utp23Q9CX11 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Utp23Q9CX11 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Utp23Q9CX11 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Utp23Q9CX11 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Utp23Q9CX11 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Utp23Q9CX11 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Utp23Q9CX11 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Utp23Q9CX11 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Utp23Q9CX11 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Utp23Q9CX11 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Utp23Q9CX11 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Utp23Q9CX11 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Utp23Q9CX11 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Utp23Q9CX11 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Utp23Q9CX11 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Utp23Q9CX11 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Utp23Q9CX11 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Utp23Q9CX11 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Utp23Q9CX11 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Utp23Q9CX11 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Utp23Q9CX11 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Utp23Q9CX11 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Utp23Q9CX11 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Utp23Q9CX11 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Utp23Q9CX11 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Utp23Q9CX11 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Utp23Q9CX11 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Utp23Q9CX11 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Utp23Q9CX11 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Utp23Q9CX11 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Utp23Q9CX11 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Utp23Q9CX11 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Utp23Q9CX11 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Utp23Q9CX11 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Utp23Q9CX11 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Utp23Q9CX11 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Utp23Q9CX11 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Utp23Q9CX11 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Utp23Q9CX11 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Utp23Q9CX11 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Utp23Q9CX11 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Utp23Q9CX11 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Utp23Q9CX11 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Utp23Q9CX11 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
Utp23Q9CX11 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Utp23Q9CX11 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Utp23Q9CX11 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Utp23Q9CX11 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Utp23Q9CX11 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Utp23Q9CX11 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Utp23Q9CX11 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Utp23Q9CX11 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Utp23Q9CX11 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Utp23Q9CX11 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Utp23Q9CX11 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Utp23Q9CX11 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Utp23Q9CX11 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Utp23Q9CX11 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Utp23Q9CX11 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Utp23Q9CX11 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Utp23Q9CX11 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Utp23Q9CX11 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Utp23Q9CX11 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Utp23Q9CX11 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Utp23Q9CX11 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Utp23Q9CX11 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Utp23Q9CX11 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Utp23Q9CX11 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Utp23Q9CX11 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Utp23Q9CX11 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms