Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK3

Rdm1, RAD52 motif-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdm1Q9CQK3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rdm1Q9CQK3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rdm1Q9CQK3 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Rdm1Q9CQK3 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Rdm1Q9CQK3 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rdm1Q9CQK3 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rdm1Q9CQK3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rdm1Q9CQK3 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Rdm1Q9CQK3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rdm1Q9CQK3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rdm1Q9CQK3 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Rdm1Q9CQK3 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Rdm1Q9CQK3 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rdm1Q9CQK3 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rdm1Q9CQK3 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rdm1Q9CQK3 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Rdm1Q9CQK3 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Rdm1Q9CQK3 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rdm1Q9CQK3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rdm1Q9CQK3 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rdm1Q9CQK3 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rdm1Q9CQK3 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Rdm1Q9CQK3 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rdm1Q9CQK3 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Rdm1Q9CQK3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Rdm1Q9CQK3 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Rdm1Q9CQK3 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Rdm1Q9CQK3 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Rdm1Q9CQK3 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Rdm1Q9CQK3 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Rdm1Q9CQK3 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Rdm1Q9CQK3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rdm1Q9CQK3 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rdm1Q9CQK3 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rdm1Q9CQK3 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rdm1Q9CQK3 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rdm1Q9CQK3 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rdm1Q9CQK3 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rdm1Q9CQK3 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rdm1Q9CQK3 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rdm1Q9CQK3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rdm1Q9CQK3 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rdm1Q9CQK3 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rdm1Q9CQK3 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rdm1Q9CQK3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rdm1Q9CQK3 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rdm1Q9CQK3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rdm1Q9CQK3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rdm1Q9CQK3 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rdm1Q9CQK3 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Rdm1Q9CQK3 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rdm1Q9CQK3 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rdm1Q9CQK3 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rdm1Q9CQK3 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rdm1Q9CQK3 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rdm1Q9CQK3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rdm1Q9CQK3 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rdm1Q9CQK3 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rdm1Q9CQK3 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rdm1Q9CQK3 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rdm1Q9CQK3 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rdm1Q9CQK3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Rdm1Q9CQK3 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Rdm1Q9CQK3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Rdm1Q9CQK3 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Rdm1Q9CQK3 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Rdm1Q9CQK3 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Rdm1Q9CQK3 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Rdm1Q9CQK3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Rdm1Q9CQK3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Rdm1Q9CQK3 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Rdm1Q9CQK3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rdm1Q9CQK3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rdm1Q9CQK3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rdm1Q9CQK3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rdm1Q9CQK3 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rdm1Q9CQK3 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rdm1Q9CQK3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rdm1Q9CQK3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rdm1Q9CQK3 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rdm1Q9CQK3 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rdm1Q9CQK3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rdm1Q9CQK3 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Rdm1Q9CQK3 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Rdm1Q9CQK3 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Rdm1Q9CQK3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Rdm1Q9CQK3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Rdm1Q9CQK3 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Rdm1Q9CQK3 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Rdm1Q9CQK3 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Rdm1Q9CQK3 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Rdm1Q9CQK3 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Rdm1Q9CQK3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Rdm1Q9CQK3 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Rdm1Q9CQK3 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Rdm1Q9CQK3 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Rdm1Q9CQK3 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Rdm1Q9CQK3 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Rdm1Q9CQK3 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Rdm1Q9CQK3 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms