Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQI7

Snrpb2, U2 small nuclear ribonucleoprotein B'', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpb2Q9CQI7 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Snrpb2Q9CQI7 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Snrpb2Q9CQI7 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Snrpb2Q9CQI7 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Snrpb2Q9CQI7 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Snrpb2Q9CQI7 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Snrpb2Q9CQI7 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Snrpb2Q9CQI7 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Snrpb2Q9CQI7 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Snrpb2Q9CQI7 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Snrpb2Q9CQI7 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Snrpb2Q9CQI7 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Snrpb2Q9CQI7 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Snrpb2Q9CQI7 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Snrpb2Q9CQI7 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Snrpb2Q9CQI7 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Snrpb2Q9CQI7 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Snrpb2Q9CQI7 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Snrpb2Q9CQI7 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Snrpb2Q9CQI7 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Snrpb2Q9CQI7 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Snrpb2Q9CQI7 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Snrpb2Q9CQI7 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Snrpb2Q9CQI7 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Snrpb2Q9CQI7 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Snrpb2Q9CQI7 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Snrpb2Q9CQI7 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Snrpb2Q9CQI7 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Snrpb2Q9CQI7 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Snrpb2Q9CQI7 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Snrpb2Q9CQI7 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Snrpb2Q9CQI7 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Snrpb2Q9CQI7 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Snrpb2Q9CQI7 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Snrpb2Q9CQI7 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Snrpb2Q9CQI7 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Snrpb2Q9CQI7 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Snrpb2Q9CQI7 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Snrpb2Q9CQI7 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Snrpb2Q9CQI7 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Snrpb2Q9CQI7 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Snrpb2Q9CQI7 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Snrpb2Q9CQI7 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Snrpb2Q9CQI7 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Snrpb2Q9CQI7 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Snrpb2Q9CQI7 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Snrpb2Q9CQI7 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Snrpb2Q9CQI7 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Snrpb2Q9CQI7 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Snrpb2Q9CQI7 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Snrpb2Q9CQI7 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Snrpb2Q9CQI7 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Snrpb2Q9CQI7 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Snrpb2Q9CQI7 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Snrpb2Q9CQI7 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Snrpb2Q9CQI7 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Snrpb2Q9CQI7 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Snrpb2Q9CQI7 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Snrpb2Q9CQI7 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Snrpb2Q9CQI7 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Snrpb2Q9CQI7 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Snrpb2Q9CQI7 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Snrpb2Q9CQI7 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Snrpb2Q9CQI7 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Snrpb2Q9CQI7 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Snrpb2Q9CQI7 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Snrpb2Q9CQI7 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Snrpb2Q9CQI7 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Snrpb2Q9CQI7 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Snrpb2Q9CQI7 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Snrpb2Q9CQI7 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Snrpb2Q9CQI7 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Snrpb2Q9CQI7 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Snrpb2Q9CQI7 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Snrpb2Q9CQI7 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Snrpb2Q9CQI7 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Snrpb2Q9CQI7 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Snrpb2Q9CQI7 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Snrpb2Q9CQI7 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Snrpb2Q9CQI7 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Snrpb2Q9CQI7 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Snrpb2Q9CQI7 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Snrpb2Q9CQI7 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Snrpb2Q9CQI7 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Snrpb2Q9CQI7 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Snrpb2Q9CQI7 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Snrpb2Q9CQI7 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Snrpb2Q9CQI7 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Snrpb2Q9CQI7 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Snrpb2Q9CQI7 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Snrpb2Q9CQI7 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Snrpb2Q9CQI7 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Snrpb2Q9CQI7 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Snrpb2Q9CQI7 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Snrpb2Q9CQI7 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Snrpb2Q9CQI7 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Snrpb2Q9CQI7 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Snrpb2Q9CQI7 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Snrpb2Q9CQI7 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Snrpb2Q9CQI7 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms