Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ48

Nudcd2, NudC domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudcd2Q9CQ48 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nudcd2Q9CQ48 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nudcd2Q9CQ48 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Nudcd2Q9CQ48 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nudcd2Q9CQ48 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nudcd2Q9CQ48 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nudcd2Q9CQ48 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nudcd2Q9CQ48 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Nudcd2Q9CQ48 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nudcd2Q9CQ48 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nudcd2Q9CQ48 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Nudcd2Q9CQ48 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nudcd2Q9CQ48 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nudcd2Q9CQ48 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nudcd2Q9CQ48 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nudcd2Q9CQ48 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nudcd2Q9CQ48 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nudcd2Q9CQ48 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nudcd2Q9CQ48 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nudcd2Q9CQ48 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nudcd2Q9CQ48 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nudcd2Q9CQ48 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nudcd2Q9CQ48 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nudcd2Q9CQ48 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nudcd2Q9CQ48 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nudcd2Q9CQ48 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Nudcd2Q9CQ48 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nudcd2Q9CQ48 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nudcd2Q9CQ48 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nudcd2Q9CQ48 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nudcd2Q9CQ48 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nudcd2Q9CQ48 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nudcd2Q9CQ48 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nudcd2Q9CQ48 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nudcd2Q9CQ48 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nudcd2Q9CQ48 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nudcd2Q9CQ48 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nudcd2Q9CQ48 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nudcd2Q9CQ48 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nudcd2Q9CQ48 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nudcd2Q9CQ48 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nudcd2Q9CQ48 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nudcd2Q9CQ48 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nudcd2Q9CQ48 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nudcd2Q9CQ48 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nudcd2Q9CQ48 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nudcd2Q9CQ48 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nudcd2Q9CQ48 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nudcd2Q9CQ48 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nudcd2Q9CQ48 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nudcd2Q9CQ48 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nudcd2Q9CQ48 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nudcd2Q9CQ48 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nudcd2Q9CQ48 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nudcd2Q9CQ48 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nudcd2Q9CQ48 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nudcd2Q9CQ48 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nudcd2Q9CQ48 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nudcd2Q9CQ48 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nudcd2Q9CQ48 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nudcd2Q9CQ48 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nudcd2Q9CQ48 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nudcd2Q9CQ48 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nudcd2Q9CQ48 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nudcd2Q9CQ48 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nudcd2Q9CQ48 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Nudcd2Q9CQ48 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Nudcd2Q9CQ48 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nudcd2Q9CQ48 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nudcd2Q9CQ48 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nudcd2Q9CQ48 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nudcd2Q9CQ48 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nudcd2Q9CQ48 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nudcd2Q9CQ48 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nudcd2Q9CQ48 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nudcd2Q9CQ48 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nudcd2Q9CQ48 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nudcd2Q9CQ48 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nudcd2Q9CQ48 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nudcd2Q9CQ48 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nudcd2Q9CQ48 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nudcd2Q9CQ48 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nudcd2Q9CQ48 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nudcd2Q9CQ48 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nudcd2Q9CQ48 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nudcd2Q9CQ48 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nudcd2Q9CQ48 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nudcd2Q9CQ48 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nudcd2Q9CQ48 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nudcd2Q9CQ48 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nudcd2Q9CQ48 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nudcd2Q9CQ48 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nudcd2Q9CQ48 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nudcd2Q9CQ48 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nudcd2Q9CQ48 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nudcd2Q9CQ48 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nudcd2Q9CQ48 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nudcd2Q9CQ48 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Nudcd2Q9CQ48 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nudcd2Q9CQ48 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms