Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF3

Cep41, Centrosomal protein of 41 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep41Q99NF3 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cep41Q99NF3 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Cep41Q99NF3 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Cep41Q99NF3 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cep41Q99NF3 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cep41Q99NF3 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Cep41Q99NF3 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Cep41Q99NF3 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cep41Q99NF3 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cep41Q99NF3 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cep41Q99NF3 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cep41Q99NF3 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cep41Q99NF3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cep41Q99NF3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cep41Q99NF3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cep41Q99NF3 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cep41Q99NF3 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cep41Q99NF3 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cep41Q99NF3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cep41Q99NF3 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cep41Q99NF3 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cep41Q99NF3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cep41Q99NF3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cep41Q99NF3 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cep41Q99NF3 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cep41Q99NF3 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cep41Q99NF3 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cep41Q99NF3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cep41Q99NF3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cep41Q99NF3 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cep41Q99NF3 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cep41Q99NF3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cep41Q99NF3 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cep41Q99NF3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cep41Q99NF3 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cep41Q99NF3 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Cep41Q99NF3 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Cep41Q99NF3 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Cep41Q99NF3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cep41Q99NF3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cep41Q99NF3 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cep41Q99NF3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cep41Q99NF3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cep41Q99NF3 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cep41Q99NF3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Cep41Q99NF3 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Cep41Q99NF3 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
Cep41Q99NF3 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cep41Q99NF3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cep41Q99NF3 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cep41Q99NF3 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cep41Q99NF3 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cep41Q99NF3 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cep41Q99NF3 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cep41Q99NF3 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cep41Q99NF3 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cep41Q99NF3 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cep41Q99NF3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cep41Q99NF3 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cep41Q99NF3 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cep41Q99NF3 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cep41Q99NF3 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cep41Q99NF3 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cep41Q99NF3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cep41Q99NF3 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cep41Q99NF3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cep41Q99NF3 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cep41Q99NF3 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cep41Q99NF3 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cep41Q99NF3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cep41Q99NF3 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cep41Q99NF3 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cep41Q99NF3 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cep41Q99NF3 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cep41Q99NF3 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cep41Q99NF3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cep41Q99NF3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cep41Q99NF3 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cep41Q99NF3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cep41Q99NF3 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cep41Q99NF3 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Cep41Q99NF3 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cep41Q99NF3 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cep41Q99NF3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cep41Q99NF3 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cep41Q99NF3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Cep41Q99NF3 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cep41Q99NF3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cep41Q99NF3 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cep41Q99NF3 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cep41Q99NF3 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cep41Q99NF3 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Cep41Q99NF3 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cep41Q99NF3 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cep41Q99NF3 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cep41Q99NF3 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cep41Q99NF3 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cep41Q99NF3 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cep41Q99NF3 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cep41Q99NF3 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.8 ms