Protein–RNA interactions for Protein: Q99KP6

Prpf19, Pre-mRNA-processing factor 19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf19Q99KP6 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prpf19Q99KP6 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prpf19Q99KP6 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prpf19Q99KP6 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prpf19Q99KP6 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prpf19Q99KP6 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prpf19Q99KP6 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prpf19Q99KP6 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Prpf19Q99KP6 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Prpf19Q99KP6 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Prpf19Q99KP6 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Prpf19Q99KP6 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Prpf19Q99KP6 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Prpf19Q99KP6 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Prpf19Q99KP6 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Prpf19Q99KP6 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Prpf19Q99KP6 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Prpf19Q99KP6 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Prpf19Q99KP6 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Prpf19Q99KP6 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Prpf19Q99KP6 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Prpf19Q99KP6 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Prpf19Q99KP6 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Prpf19Q99KP6 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Prpf19Q99KP6 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Prpf19Q99KP6 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prpf19Q99KP6 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prpf19Q99KP6 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prpf19Q99KP6 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Prpf19Q99KP6 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prpf19Q99KP6 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prpf19Q99KP6 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prpf19Q99KP6 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prpf19Q99KP6 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prpf19Q99KP6 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prpf19Q99KP6 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prpf19Q99KP6 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prpf19Q99KP6 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prpf19Q99KP6 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prpf19Q99KP6 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prpf19Q99KP6 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prpf19Q99KP6 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prpf19Q99KP6 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prpf19Q99KP6 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prpf19Q99KP6 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prpf19Q99KP6 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Prpf19Q99KP6 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Prpf19Q99KP6 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Prpf19Q99KP6 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Prpf19Q99KP6 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prpf19Q99KP6 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prpf19Q99KP6 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prpf19Q99KP6 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prpf19Q99KP6 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prpf19Q99KP6 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prpf19Q99KP6 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prpf19Q99KP6 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prpf19Q99KP6 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prpf19Q99KP6 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prpf19Q99KP6 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prpf19Q99KP6 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prpf19Q99KP6 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prpf19Q99KP6 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prpf19Q99KP6 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prpf19Q99KP6 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Prpf19Q99KP6 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prpf19Q99KP6 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prpf19Q99KP6 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prpf19Q99KP6 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prpf19Q99KP6 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prpf19Q99KP6 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prpf19Q99KP6 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prpf19Q99KP6 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prpf19Q99KP6 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prpf19Q99KP6 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prpf19Q99KP6 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prpf19Q99KP6 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prpf19Q99KP6 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Prpf19Q99KP6 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Prpf19Q99KP6 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Prpf19Q99KP6 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Prpf19Q99KP6 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prpf19Q99KP6 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prpf19Q99KP6 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prpf19Q99KP6 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prpf19Q99KP6 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prpf19Q99KP6 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prpf19Q99KP6 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prpf19Q99KP6 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prpf19Q99KP6 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prpf19Q99KP6 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prpf19Q99KP6 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Prpf19Q99KP6 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prpf19Q99KP6 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Prpf19Q99KP6 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prpf19Q99KP6 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prpf19Q99KP6 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prpf19Q99KP6 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prpf19Q99KP6 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prpf19Q99KP6 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms