Protein–RNA interactions for Protein: Q921I6

Sh3bp4, SH3 domain-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp4Q921I6 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sh3bp4Q921I6 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sh3bp4Q921I6 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sh3bp4Q921I6 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sh3bp4Q921I6 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sh3bp4Q921I6 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sh3bp4Q921I6 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sh3bp4Q921I6 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sh3bp4Q921I6 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sh3bp4Q921I6 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sh3bp4Q921I6 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Sh3bp4Q921I6 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sh3bp4Q921I6 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sh3bp4Q921I6 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sh3bp4Q921I6 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sh3bp4Q921I6 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sh3bp4Q921I6 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sh3bp4Q921I6 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sh3bp4Q921I6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sh3bp4Q921I6 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Sh3bp4Q921I6 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sh3bp4Q921I6 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sh3bp4Q921I6 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Sh3bp4Q921I6 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sh3bp4Q921I6 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Sh3bp4Q921I6 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sh3bp4Q921I6 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sh3bp4Q921I6 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sh3bp4Q921I6 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sh3bp4Q921I6 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sh3bp4Q921I6 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sh3bp4Q921I6 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Sh3bp4Q921I6 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Sh3bp4Q921I6 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Sh3bp4Q921I6 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sh3bp4Q921I6 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sh3bp4Q921I6 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Sh3bp4Q921I6 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sh3bp4Q921I6 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Sh3bp4Q921I6 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sh3bp4Q921I6 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Sh3bp4Q921I6 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Sh3bp4Q921I6 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Sh3bp4Q921I6 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Sh3bp4Q921I6 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sh3bp4Q921I6 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sh3bp4Q921I6 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sh3bp4Q921I6 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Sh3bp4Q921I6 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sh3bp4Q921I6 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sh3bp4Q921I6 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sh3bp4Q921I6 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sh3bp4Q921I6 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sh3bp4Q921I6 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sh3bp4Q921I6 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sh3bp4Q921I6 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sh3bp4Q921I6 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sh3bp4Q921I6 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sh3bp4Q921I6 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sh3bp4Q921I6 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Sh3bp4Q921I6 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sh3bp4Q921I6 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sh3bp4Q921I6 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sh3bp4Q921I6 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sh3bp4Q921I6 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sh3bp4Q921I6 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sh3bp4Q921I6 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sh3bp4Q921I6 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sh3bp4Q921I6 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sh3bp4Q921I6 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sh3bp4Q921I6 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sh3bp4Q921I6 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sh3bp4Q921I6 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sh3bp4Q921I6 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sh3bp4Q921I6 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sh3bp4Q921I6 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Sh3bp4Q921I6 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sh3bp4Q921I6 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sh3bp4Q921I6 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sh3bp4Q921I6 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sh3bp4Q921I6 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sh3bp4Q921I6 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sh3bp4Q921I6 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sh3bp4Q921I6 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sh3bp4Q921I6 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sh3bp4Q921I6 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sh3bp4Q921I6 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sh3bp4Q921I6 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sh3bp4Q921I6 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sh3bp4Q921I6 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Sh3bp4Q921I6 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sh3bp4Q921I6 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sh3bp4Q921I6 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sh3bp4Q921I6 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sh3bp4Q921I6 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sh3bp4Q921I6 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sh3bp4Q921I6 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sh3bp4Q921I6 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sh3bp4Q921I6 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sh3bp4Q921I6 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms