Protein–RNA interactions for Protein: Q91Y13

Pcdha7, Protocadherin alpha-7, mousemouse

Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdha7Q91Y13 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pcdha7Q91Y13 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pcdha7Q91Y13 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pcdha7Q91Y13 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pcdha7Q91Y13 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pcdha7Q91Y13 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pcdha7Q91Y13 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pcdha7Q91Y13 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Pcdha7Q91Y13 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pcdha7Q91Y13 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pcdha7Q91Y13 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pcdha7Q91Y13 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pcdha7Q91Y13 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pcdha7Q91Y13 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pcdha7Q91Y13 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pcdha7Q91Y13 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Pcdha7Q91Y13 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Pcdha7Q91Y13 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pcdha7Q91Y13 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pcdha7Q91Y13 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pcdha7Q91Y13 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pcdha7Q91Y13 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pcdha7Q91Y13 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pcdha7Q91Y13 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pcdha7Q91Y13 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pcdha7Q91Y13 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pcdha7Q91Y13 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pcdha7Q91Y13 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pcdha7Q91Y13 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pcdha7Q91Y13 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pcdha7Q91Y13 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pcdha7Q91Y13 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pcdha7Q91Y13 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pcdha7Q91Y13 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pcdha7Q91Y13 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pcdha7Q91Y13 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pcdha7Q91Y13 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pcdha7Q91Y13 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pcdha7Q91Y13 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pcdha7Q91Y13 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pcdha7Q91Y13 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pcdha7Q91Y13 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Pcdha7Q91Y13 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pcdha7Q91Y13 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pcdha7Q91Y13 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pcdha7Q91Y13 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pcdha7Q91Y13 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pcdha7Q91Y13 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pcdha7Q91Y13 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pcdha7Q91Y13 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pcdha7Q91Y13 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Pcdha7Q91Y13 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pcdha7Q91Y13 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pcdha7Q91Y13 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pcdha7Q91Y13 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pcdha7Q91Y13 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pcdha7Q91Y13 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pcdha7Q91Y13 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pcdha7Q91Y13 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pcdha7Q91Y13 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pcdha7Q91Y13 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pcdha7Q91Y13 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pcdha7Q91Y13 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pcdha7Q91Y13 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pcdha7Q91Y13 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pcdha7Q91Y13 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pcdha7Q91Y13 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pcdha7Q91Y13 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pcdha7Q91Y13 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pcdha7Q91Y13 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pcdha7Q91Y13 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pcdha7Q91Y13 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pcdha7Q91Y13 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pcdha7Q91Y13 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pcdha7Q91Y13 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pcdha7Q91Y13 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pcdha7Q91Y13 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pcdha7Q91Y13 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pcdha7Q91Y13 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pcdha7Q91Y13 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pcdha7Q91Y13 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Pcdha7Q91Y13 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pcdha7Q91Y13 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pcdha7Q91Y13 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pcdha7Q91Y13 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pcdha7Q91Y13 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pcdha7Q91Y13 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pcdha7Q91Y13 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pcdha7Q91Y13 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pcdha7Q91Y13 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pcdha7Q91Y13 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pcdha7Q91Y13 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pcdha7Q91Y13 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pcdha7Q91Y13 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pcdha7Q91Y13 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pcdha7Q91Y13 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pcdha7Q91Y13 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pcdha7Q91Y13 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pcdha7Q91Y13 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pcdha7Q91Y13 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms