Protein–RNA interactions for Protein: Q91XD2

Lims2, LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lims2Q91XD2 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lims2Q91XD2 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lims2Q91XD2 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Lims2Q91XD2 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lims2Q91XD2 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lims2Q91XD2 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Lims2Q91XD2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lims2Q91XD2 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lims2Q91XD2 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lims2Q91XD2 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lims2Q91XD2 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lims2Q91XD2 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lims2Q91XD2 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lims2Q91XD2 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lims2Q91XD2 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Lims2Q91XD2 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lims2Q91XD2 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Lims2Q91XD2 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lims2Q91XD2 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lims2Q91XD2 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lims2Q91XD2 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lims2Q91XD2 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lims2Q91XD2 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Lims2Q91XD2 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lims2Q91XD2 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lims2Q91XD2 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lims2Q91XD2 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lims2Q91XD2 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lims2Q91XD2 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Lims2Q91XD2 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lims2Q91XD2 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lims2Q91XD2 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lims2Q91XD2 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lims2Q91XD2 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lims2Q91XD2 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lims2Q91XD2 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lims2Q91XD2 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lims2Q91XD2 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lims2Q91XD2 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lims2Q91XD2 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lims2Q91XD2 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lims2Q91XD2 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lims2Q91XD2 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lims2Q91XD2 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lims2Q91XD2 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lims2Q91XD2 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lims2Q91XD2 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lims2Q91XD2 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lims2Q91XD2 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lims2Q91XD2 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lims2Q91XD2 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lims2Q91XD2 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lims2Q91XD2 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lims2Q91XD2 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lims2Q91XD2 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lims2Q91XD2 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lims2Q91XD2 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lims2Q91XD2 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Lims2Q91XD2 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Lims2Q91XD2 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Lims2Q91XD2 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lims2Q91XD2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lims2Q91XD2 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lims2Q91XD2 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lims2Q91XD2 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lims2Q91XD2 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lims2Q91XD2 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Lims2Q91XD2 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Lims2Q91XD2 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lims2Q91XD2 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lims2Q91XD2 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lims2Q91XD2 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lims2Q91XD2 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lims2Q91XD2 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lims2Q91XD2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lims2Q91XD2 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lims2Q91XD2 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lims2Q91XD2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lims2Q91XD2 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lims2Q91XD2 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lims2Q91XD2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lims2Q91XD2 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lims2Q91XD2 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lims2Q91XD2 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lims2Q91XD2 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lims2Q91XD2 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lims2Q91XD2 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lims2Q91XD2 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lims2Q91XD2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lims2Q91XD2 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lims2Q91XD2 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lims2Q91XD2 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lims2Q91XD2 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lims2Q91XD2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lims2Q91XD2 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lims2Q91XD2 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lims2Q91XD2 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lims2Q91XD2 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lims2Q91XD2 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lims2Q91XD2 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms