Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1N4

Nudcd3, NudC domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudcd3Q8R1N4 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nudcd3Q8R1N4 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nudcd3Q8R1N4 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nudcd3Q8R1N4 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nudcd3Q8R1N4 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nudcd3Q8R1N4 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nudcd3Q8R1N4 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Nudcd3Q8R1N4 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nudcd3Q8R1N4 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nudcd3Q8R1N4 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nudcd3Q8R1N4 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nudcd3Q8R1N4 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nudcd3Q8R1N4 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nudcd3Q8R1N4 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nudcd3Q8R1N4 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nudcd3Q8R1N4 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nudcd3Q8R1N4 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nudcd3Q8R1N4 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nudcd3Q8R1N4 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nudcd3Q8R1N4 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nudcd3Q8R1N4 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nudcd3Q8R1N4 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nudcd3Q8R1N4 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nudcd3Q8R1N4 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nudcd3Q8R1N4 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nudcd3Q8R1N4 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nudcd3Q8R1N4 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nudcd3Q8R1N4 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nudcd3Q8R1N4 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nudcd3Q8R1N4 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nudcd3Q8R1N4 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nudcd3Q8R1N4 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nudcd3Q8R1N4 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nudcd3Q8R1N4 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nudcd3Q8R1N4 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nudcd3Q8R1N4 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nudcd3Q8R1N4 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nudcd3Q8R1N4 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nudcd3Q8R1N4 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nudcd3Q8R1N4 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nudcd3Q8R1N4 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nudcd3Q8R1N4 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nudcd3Q8R1N4 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nudcd3Q8R1N4 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nudcd3Q8R1N4 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nudcd3Q8R1N4 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nudcd3Q8R1N4 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nudcd3Q8R1N4 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nudcd3Q8R1N4 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nudcd3Q8R1N4 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nudcd3Q8R1N4 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nudcd3Q8R1N4 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nudcd3Q8R1N4 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nudcd3Q8R1N4 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nudcd3Q8R1N4 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nudcd3Q8R1N4 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nudcd3Q8R1N4 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nudcd3Q8R1N4 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nudcd3Q8R1N4 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nudcd3Q8R1N4 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nudcd3Q8R1N4 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nudcd3Q8R1N4 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nudcd3Q8R1N4 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nudcd3Q8R1N4 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nudcd3Q8R1N4 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nudcd3Q8R1N4 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Nudcd3Q8R1N4 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nudcd3Q8R1N4 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nudcd3Q8R1N4 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nudcd3Q8R1N4 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nudcd3Q8R1N4 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nudcd3Q8R1N4 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nudcd3Q8R1N4 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nudcd3Q8R1N4 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nudcd3Q8R1N4 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nudcd3Q8R1N4 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nudcd3Q8R1N4 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nudcd3Q8R1N4 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nudcd3Q8R1N4 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nudcd3Q8R1N4 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nudcd3Q8R1N4 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Nudcd3Q8R1N4 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nudcd3Q8R1N4 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nudcd3Q8R1N4 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nudcd3Q8R1N4 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nudcd3Q8R1N4 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nudcd3Q8R1N4 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nudcd3Q8R1N4 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nudcd3Q8R1N4 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nudcd3Q8R1N4 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nudcd3Q8R1N4 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nudcd3Q8R1N4 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nudcd3Q8R1N4 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Nudcd3Q8R1N4 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nudcd3Q8R1N4 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nudcd3Q8R1N4 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nudcd3Q8R1N4 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nudcd3Q8R1N4 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nudcd3Q8R1N4 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nudcd3Q8R1N4 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms