Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIM1

Lrrc45, Leucine-rich repeat-containing protein 45, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc45Q8CIM1 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Lrrc45Q8CIM1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lrrc45Q8CIM1 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lrrc45Q8CIM1 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lrrc45Q8CIM1 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lrrc45Q8CIM1 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lrrc45Q8CIM1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lrrc45Q8CIM1 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Lrrc45Q8CIM1 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Lrrc45Q8CIM1 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lrrc45Q8CIM1 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lrrc45Q8CIM1 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lrrc45Q8CIM1 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lrrc45Q8CIM1 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lrrc45Q8CIM1 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lrrc45Q8CIM1 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lrrc45Q8CIM1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lrrc45Q8CIM1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lrrc45Q8CIM1 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lrrc45Q8CIM1 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lrrc45Q8CIM1 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lrrc45Q8CIM1 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lrrc45Q8CIM1 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lrrc45Q8CIM1 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lrrc45Q8CIM1 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Lrrc45Q8CIM1 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lrrc45Q8CIM1 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lrrc45Q8CIM1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lrrc45Q8CIM1 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lrrc45Q8CIM1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lrrc45Q8CIM1 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lrrc45Q8CIM1 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lrrc45Q8CIM1 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lrrc45Q8CIM1 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Lrrc45Q8CIM1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lrrc45Q8CIM1 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Lrrc45Q8CIM1 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Lrrc45Q8CIM1 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Lrrc45Q8CIM1 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lrrc45Q8CIM1 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lrrc45Q8CIM1 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lrrc45Q8CIM1 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lrrc45Q8CIM1 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lrrc45Q8CIM1 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lrrc45Q8CIM1 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lrrc45Q8CIM1 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lrrc45Q8CIM1 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lrrc45Q8CIM1 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lrrc45Q8CIM1 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lrrc45Q8CIM1 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lrrc45Q8CIM1 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lrrc45Q8CIM1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lrrc45Q8CIM1 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lrrc45Q8CIM1 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lrrc45Q8CIM1 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lrrc45Q8CIM1 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Lrrc45Q8CIM1 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Lrrc45Q8CIM1 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lrrc45Q8CIM1 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lrrc45Q8CIM1 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lrrc45Q8CIM1 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lrrc45Q8CIM1 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lrrc45Q8CIM1 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lrrc45Q8CIM1 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lrrc45Q8CIM1 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lrrc45Q8CIM1 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lrrc45Q8CIM1 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lrrc45Q8CIM1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lrrc45Q8CIM1 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Lrrc45Q8CIM1 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Lrrc45Q8CIM1 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Lrrc45Q8CIM1 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lrrc45Q8CIM1 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lrrc45Q8CIM1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lrrc45Q8CIM1 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lrrc45Q8CIM1 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lrrc45Q8CIM1 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Lrrc45Q8CIM1 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lrrc45Q8CIM1 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lrrc45Q8CIM1 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lrrc45Q8CIM1 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lrrc45Q8CIM1 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lrrc45Q8CIM1 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Lrrc45Q8CIM1 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lrrc45Q8CIM1 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lrrc45Q8CIM1 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lrrc45Q8CIM1 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lrrc45Q8CIM1 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lrrc45Q8CIM1 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lrrc45Q8CIM1 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lrrc45Q8CIM1 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lrrc45Q8CIM1 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lrrc45Q8CIM1 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lrrc45Q8CIM1 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lrrc45Q8CIM1 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lrrc45Q8CIM1 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lrrc45Q8CIM1 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lrrc45Q8CIM1 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lrrc45Q8CIM1 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lrrc45Q8CIM1 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms