Protein–RNA interactions for Protein: Q8CI52

Gramd1c, GRAM domain-containing protein 1C, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gramd1cQ8CI52 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gramd1cQ8CI52 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gramd1cQ8CI52 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gramd1cQ8CI52 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gramd1cQ8CI52 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gramd1cQ8CI52 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gramd1cQ8CI52 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gramd1cQ8CI52 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gramd1cQ8CI52 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gramd1cQ8CI52 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gramd1cQ8CI52 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Gramd1cQ8CI52 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gramd1cQ8CI52 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gramd1cQ8CI52 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gramd1cQ8CI52 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gramd1cQ8CI52 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gramd1cQ8CI52 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Gramd1cQ8CI52 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Gramd1cQ8CI52 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gramd1cQ8CI52 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Gramd1cQ8CI52 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Gramd1cQ8CI52 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gramd1cQ8CI52 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gramd1cQ8CI52 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gramd1cQ8CI52 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gramd1cQ8CI52 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gramd1cQ8CI52 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gramd1cQ8CI52 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gramd1cQ8CI52 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gramd1cQ8CI52 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gramd1cQ8CI52 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gramd1cQ8CI52 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gramd1cQ8CI52 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gramd1cQ8CI52 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gramd1cQ8CI52 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gramd1cQ8CI52 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gramd1cQ8CI52 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gramd1cQ8CI52 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gramd1cQ8CI52 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gramd1cQ8CI52 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gramd1cQ8CI52 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gramd1cQ8CI52 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gramd1cQ8CI52 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gramd1cQ8CI52 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gramd1cQ8CI52 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gramd1cQ8CI52 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gramd1cQ8CI52 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gramd1cQ8CI52 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gramd1cQ8CI52 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gramd1cQ8CI52 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gramd1cQ8CI52 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gramd1cQ8CI52 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gramd1cQ8CI52 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gramd1cQ8CI52 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Gramd1cQ8CI52 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gramd1cQ8CI52 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gramd1cQ8CI52 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Gramd1cQ8CI52 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gramd1cQ8CI52 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gramd1cQ8CI52 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gramd1cQ8CI52 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gramd1cQ8CI52 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Gramd1cQ8CI52 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gramd1cQ8CI52 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Gramd1cQ8CI52 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gramd1cQ8CI52 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gramd1cQ8CI52 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gramd1cQ8CI52 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gramd1cQ8CI52 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gramd1cQ8CI52 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gramd1cQ8CI52 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gramd1cQ8CI52 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Gramd1cQ8CI52 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Gramd1cQ8CI52 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gramd1cQ8CI52 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gramd1cQ8CI52 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gramd1cQ8CI52 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Gramd1cQ8CI52 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gramd1cQ8CI52 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Gramd1cQ8CI52 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gramd1cQ8CI52 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gramd1cQ8CI52 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gramd1cQ8CI52 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Gramd1cQ8CI52 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gramd1cQ8CI52 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gramd1cQ8CI52 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gramd1cQ8CI52 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gramd1cQ8CI52 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gramd1cQ8CI52 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gramd1cQ8CI52 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gramd1cQ8CI52 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gramd1cQ8CI52 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gramd1cQ8CI52 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gramd1cQ8CI52 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gramd1cQ8CI52 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gramd1cQ8CI52 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gramd1cQ8CI52 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gramd1cQ8CI52 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gramd1cQ8CI52 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Gramd1cQ8CI52 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 144.6 ms