Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDM1

Atad2, ATPase family AAA domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atad2Q8CDM1 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Atad2Q8CDM1 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Atad2Q8CDM1 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Atad2Q8CDM1 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Atad2Q8CDM1 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Atad2Q8CDM1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Atad2Q8CDM1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Atad2Q8CDM1 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Atad2Q8CDM1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Atad2Q8CDM1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Atad2Q8CDM1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Atad2Q8CDM1 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Atad2Q8CDM1 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Atad2Q8CDM1 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Atad2Q8CDM1 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Atad2Q8CDM1 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Atad2Q8CDM1 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Atad2Q8CDM1 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Atad2Q8CDM1 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Atad2Q8CDM1 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Atad2Q8CDM1 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Atad2Q8CDM1 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Atad2Q8CDM1 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Atad2Q8CDM1 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Atad2Q8CDM1 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Atad2Q8CDM1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Atad2Q8CDM1 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Atad2Q8CDM1 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Atad2Q8CDM1 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Atad2Q8CDM1 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Atad2Q8CDM1 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Atad2Q8CDM1 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Atad2Q8CDM1 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Atad2Q8CDM1 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Atad2Q8CDM1 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Atad2Q8CDM1 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Atad2Q8CDM1 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Atad2Q8CDM1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Atad2Q8CDM1 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Atad2Q8CDM1 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Atad2Q8CDM1 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Atad2Q8CDM1 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Atad2Q8CDM1 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Atad2Q8CDM1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Atad2Q8CDM1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Atad2Q8CDM1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Atad2Q8CDM1 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Atad2Q8CDM1 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Atad2Q8CDM1 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Atad2Q8CDM1 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Atad2Q8CDM1 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Atad2Q8CDM1 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Atad2Q8CDM1 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Atad2Q8CDM1 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Atad2Q8CDM1 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Atad2Q8CDM1 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Atad2Q8CDM1 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Atad2Q8CDM1 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Atad2Q8CDM1 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Atad2Q8CDM1 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Atad2Q8CDM1 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Atad2Q8CDM1 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Atad2Q8CDM1 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Atad2Q8CDM1 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Atad2Q8CDM1 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Atad2Q8CDM1 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Atad2Q8CDM1 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Atad2Q8CDM1 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Atad2Q8CDM1 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Atad2Q8CDM1 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Atad2Q8CDM1 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Atad2Q8CDM1 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Atad2Q8CDM1 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Atad2Q8CDM1 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Atad2Q8CDM1 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Atad2Q8CDM1 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Atad2Q8CDM1 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Atad2Q8CDM1 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Atad2Q8CDM1 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Atad2Q8CDM1 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Atad2Q8CDM1 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Atad2Q8CDM1 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Atad2Q8CDM1 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Atad2Q8CDM1 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Atad2Q8CDM1 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Atad2Q8CDM1 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Atad2Q8CDM1 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Atad2Q8CDM1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Atad2Q8CDM1 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Atad2Q8CDM1 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Atad2Q8CDM1 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Atad2Q8CDM1 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Atad2Q8CDM1 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Atad2Q8CDM1 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Atad2Q8CDM1 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Atad2Q8CDM1 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Atad2Q8CDM1 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Atad2Q8CDM1 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Atad2Q8CDM1 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Atad2Q8CDM1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.3 ms