Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAL5

Gpc5, Glypican-5, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc5Q8CAL5 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gpc5Q8CAL5 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Gpc5Q8CAL5 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Gpc5Q8CAL5 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Gpc5Q8CAL5 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gpc5Q8CAL5 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gpc5Q8CAL5 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gpc5Q8CAL5 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gpc5Q8CAL5 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gpc5Q8CAL5 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gpc5Q8CAL5 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gpc5Q8CAL5 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Gpc5Q8CAL5 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gpc5Q8CAL5 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gpc5Q8CAL5 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gpc5Q8CAL5 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Gpc5Q8CAL5 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gpc5Q8CAL5 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gpc5Q8CAL5 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gpc5Q8CAL5 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Gpc5Q8CAL5 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gpc5Q8CAL5 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gpc5Q8CAL5 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gpc5Q8CAL5 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gpc5Q8CAL5 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gpc5Q8CAL5 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gpc5Q8CAL5 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gpc5Q8CAL5 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gpc5Q8CAL5 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gpc5Q8CAL5 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gpc5Q8CAL5 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gpc5Q8CAL5 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gpc5Q8CAL5 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gpc5Q8CAL5 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gpc5Q8CAL5 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Gpc5Q8CAL5 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gpc5Q8CAL5 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gpc5Q8CAL5 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gpc5Q8CAL5 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gpc5Q8CAL5 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gpc5Q8CAL5 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gpc5Q8CAL5 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gpc5Q8CAL5 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gpc5Q8CAL5 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gpc5Q8CAL5 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gpc5Q8CAL5 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gpc5Q8CAL5 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gpc5Q8CAL5 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gpc5Q8CAL5 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gpc5Q8CAL5 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gpc5Q8CAL5 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gpc5Q8CAL5 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gpc5Q8CAL5 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gpc5Q8CAL5 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gpc5Q8CAL5 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gpc5Q8CAL5 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gpc5Q8CAL5 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gpc5Q8CAL5 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gpc5Q8CAL5 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gpc5Q8CAL5 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gpc5Q8CAL5 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gpc5Q8CAL5 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gpc5Q8CAL5 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gpc5Q8CAL5 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Gpc5Q8CAL5 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gpc5Q8CAL5 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gpc5Q8CAL5 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Gpc5Q8CAL5 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gpc5Q8CAL5 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gpc5Q8CAL5 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Gpc5Q8CAL5 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gpc5Q8CAL5 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gpc5Q8CAL5 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gpc5Q8CAL5 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gpc5Q8CAL5 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gpc5Q8CAL5 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Gpc5Q8CAL5 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gpc5Q8CAL5 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gpc5Q8CAL5 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gpc5Q8CAL5 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gpc5Q8CAL5 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gpc5Q8CAL5 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gpc5Q8CAL5 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gpc5Q8CAL5 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gpc5Q8CAL5 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gpc5Q8CAL5 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gpc5Q8CAL5 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gpc5Q8CAL5 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gpc5Q8CAL5 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gpc5Q8CAL5 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gpc5Q8CAL5 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gpc5Q8CAL5 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gpc5Q8CAL5 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gpc5Q8CAL5 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gpc5Q8CAL5 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gpc5Q8CAL5 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gpc5Q8CAL5 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Gpc5Q8CAL5 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gpc5Q8CAL5 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gpc5Q8CAL5 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms