Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2B3

Hdac7, Histone deacetylase 7, mousemouse

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Length 938 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac7Q8C2B3 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hdac7Q8C2B3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hdac7Q8C2B3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hdac7Q8C2B3 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hdac7Q8C2B3 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hdac7Q8C2B3 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hdac7Q8C2B3 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hdac7Q8C2B3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hdac7Q8C2B3 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hdac7Q8C2B3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hdac7Q8C2B3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hdac7Q8C2B3 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hdac7Q8C2B3 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hdac7Q8C2B3 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hdac7Q8C2B3 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hdac7Q8C2B3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hdac7Q8C2B3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hdac7Q8C2B3 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hdac7Q8C2B3 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hdac7Q8C2B3 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hdac7Q8C2B3 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hdac7Q8C2B3 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hdac7Q8C2B3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hdac7Q8C2B3 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hdac7Q8C2B3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hdac7Q8C2B3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hdac7Q8C2B3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hdac7Q8C2B3 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hdac7Q8C2B3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hdac7Q8C2B3 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hdac7Q8C2B3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hdac7Q8C2B3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hdac7Q8C2B3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hdac7Q8C2B3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hdac7Q8C2B3 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hdac7Q8C2B3 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hdac7Q8C2B3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hdac7Q8C2B3 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hdac7Q8C2B3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hdac7Q8C2B3 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hdac7Q8C2B3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hdac7Q8C2B3 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hdac7Q8C2B3 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hdac7Q8C2B3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hdac7Q8C2B3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hdac7Q8C2B3 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hdac7Q8C2B3 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hdac7Q8C2B3 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hdac7Q8C2B3 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hdac7Q8C2B3 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hdac7Q8C2B3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hdac7Q8C2B3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hdac7Q8C2B3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Hdac7Q8C2B3 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hdac7Q8C2B3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hdac7Q8C2B3 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hdac7Q8C2B3 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hdac7Q8C2B3 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hdac7Q8C2B3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hdac7Q8C2B3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hdac7Q8C2B3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hdac7Q8C2B3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hdac7Q8C2B3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hdac7Q8C2B3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hdac7Q8C2B3 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hdac7Q8C2B3 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hdac7Q8C2B3 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Hdac7Q8C2B3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hdac7Q8C2B3 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hdac7Q8C2B3 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hdac7Q8C2B3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hdac7Q8C2B3 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hdac7Q8C2B3 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Hdac7Q8C2B3 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hdac7Q8C2B3 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hdac7Q8C2B3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hdac7Q8C2B3 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hdac7Q8C2B3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hdac7Q8C2B3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hdac7Q8C2B3 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hdac7Q8C2B3 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hdac7Q8C2B3 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hdac7Q8C2B3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hdac7Q8C2B3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hdac7Q8C2B3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hdac7Q8C2B3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hdac7Q8C2B3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hdac7Q8C2B3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hdac7Q8C2B3 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hdac7Q8C2B3 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hdac7Q8C2B3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hdac7Q8C2B3 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Hdac7Q8C2B3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hdac7Q8C2B3 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hdac7Q8C2B3 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hdac7Q8C2B3 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Hdac7Q8C2B3 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hdac7Q8C2B3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hdac7Q8C2B3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Hdac7Q8C2B3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
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