Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZI6

Lrsam1, E3 ubiquitin-protein ligase LRSAM1, mousemouse

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrsam1Q80ZI6 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lrsam1Q80ZI6 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lrsam1Q80ZI6 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lrsam1Q80ZI6 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lrsam1Q80ZI6 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lrsam1Q80ZI6 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lrsam1Q80ZI6 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lrsam1Q80ZI6 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lrsam1Q80ZI6 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lrsam1Q80ZI6 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lrsam1Q80ZI6 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lrsam1Q80ZI6 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lrsam1Q80ZI6 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lrsam1Q80ZI6 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lrsam1Q80ZI6 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lrsam1Q80ZI6 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lrsam1Q80ZI6 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lrsam1Q80ZI6 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lrsam1Q80ZI6 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lrsam1Q80ZI6 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lrsam1Q80ZI6 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lrsam1Q80ZI6 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lrsam1Q80ZI6 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lrsam1Q80ZI6 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lrsam1Q80ZI6 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lrsam1Q80ZI6 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lrsam1Q80ZI6 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lrsam1Q80ZI6 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lrsam1Q80ZI6 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lrsam1Q80ZI6 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lrsam1Q80ZI6 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lrsam1Q80ZI6 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Lrsam1Q80ZI6 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Lrsam1Q80ZI6 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Lrsam1Q80ZI6 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lrsam1Q80ZI6 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lrsam1Q80ZI6 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lrsam1Q80ZI6 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lrsam1Q80ZI6 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lrsam1Q80ZI6 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lrsam1Q80ZI6 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lrsam1Q80ZI6 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lrsam1Q80ZI6 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lrsam1Q80ZI6 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lrsam1Q80ZI6 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lrsam1Q80ZI6 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lrsam1Q80ZI6 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lrsam1Q80ZI6 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lrsam1Q80ZI6 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lrsam1Q80ZI6 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lrsam1Q80ZI6 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lrsam1Q80ZI6 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lrsam1Q80ZI6 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lrsam1Q80ZI6 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lrsam1Q80ZI6 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lrsam1Q80ZI6 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lrsam1Q80ZI6 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lrsam1Q80ZI6 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lrsam1Q80ZI6 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lrsam1Q80ZI6 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Lrsam1Q80ZI6 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lrsam1Q80ZI6 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lrsam1Q80ZI6 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lrsam1Q80ZI6 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lrsam1Q80ZI6 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lrsam1Q80ZI6 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lrsam1Q80ZI6 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lrsam1Q80ZI6 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lrsam1Q80ZI6 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lrsam1Q80ZI6 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lrsam1Q80ZI6 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lrsam1Q80ZI6 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lrsam1Q80ZI6 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lrsam1Q80ZI6 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lrsam1Q80ZI6 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lrsam1Q80ZI6 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lrsam1Q80ZI6 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lrsam1Q80ZI6 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lrsam1Q80ZI6 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lrsam1Q80ZI6 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lrsam1Q80ZI6 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lrsam1Q80ZI6 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lrsam1Q80ZI6 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lrsam1Q80ZI6 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lrsam1Q80ZI6 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lrsam1Q80ZI6 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lrsam1Q80ZI6 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lrsam1Q80ZI6 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lrsam1Q80ZI6 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Lrsam1Q80ZI6 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lrsam1Q80ZI6 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lrsam1Q80ZI6 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Lrsam1Q80ZI6 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Lrsam1Q80ZI6 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lrsam1Q80ZI6 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lrsam1Q80ZI6 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lrsam1Q80ZI6 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lrsam1Q80ZI6 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lrsam1Q80ZI6 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lrsam1Q80ZI6 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms