Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ11

Chsy1, Chondroitin sulfate synthase 1, mousemouse

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Length 800 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chsy1Q6ZQ11 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Chsy1Q6ZQ11 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Chsy1Q6ZQ11 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Chsy1Q6ZQ11 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Chsy1Q6ZQ11 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Chsy1Q6ZQ11 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Chsy1Q6ZQ11 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Chsy1Q6ZQ11 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Chsy1Q6ZQ11 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Chsy1Q6ZQ11 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Chsy1Q6ZQ11 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Chsy1Q6ZQ11 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Chsy1Q6ZQ11 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Chsy1Q6ZQ11 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Chsy1Q6ZQ11 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Chsy1Q6ZQ11 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Chsy1Q6ZQ11 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Chsy1Q6ZQ11 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Chsy1Q6ZQ11 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Chsy1Q6ZQ11 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Chsy1Q6ZQ11 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Chsy1Q6ZQ11 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Chsy1Q6ZQ11 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Chsy1Q6ZQ11 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Chsy1Q6ZQ11 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Chsy1Q6ZQ11 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Chsy1Q6ZQ11 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Chsy1Q6ZQ11 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Chsy1Q6ZQ11 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Chsy1Q6ZQ11 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Chsy1Q6ZQ11 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Chsy1Q6ZQ11 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Chsy1Q6ZQ11 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Chsy1Q6ZQ11 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Chsy1Q6ZQ11 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Chsy1Q6ZQ11 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Chsy1Q6ZQ11 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Chsy1Q6ZQ11 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Chsy1Q6ZQ11 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Chsy1Q6ZQ11 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Chsy1Q6ZQ11 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Chsy1Q6ZQ11 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Chsy1Q6ZQ11 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Chsy1Q6ZQ11 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Chsy1Q6ZQ11 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Chsy1Q6ZQ11 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Chsy1Q6ZQ11 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Chsy1Q6ZQ11 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Chsy1Q6ZQ11 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Chsy1Q6ZQ11 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Chsy1Q6ZQ11 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Chsy1Q6ZQ11 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Chsy1Q6ZQ11 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Chsy1Q6ZQ11 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Chsy1Q6ZQ11 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Chsy1Q6ZQ11 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Chsy1Q6ZQ11 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Chsy1Q6ZQ11 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Chsy1Q6ZQ11 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Chsy1Q6ZQ11 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Chsy1Q6ZQ11 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Chsy1Q6ZQ11 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Chsy1Q6ZQ11 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Chsy1Q6ZQ11 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Chsy1Q6ZQ11 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Chsy1Q6ZQ11 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Chsy1Q6ZQ11 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Chsy1Q6ZQ11 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Chsy1Q6ZQ11 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Chsy1Q6ZQ11 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Chsy1Q6ZQ11 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Chsy1Q6ZQ11 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Chsy1Q6ZQ11 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Chsy1Q6ZQ11 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Chsy1Q6ZQ11 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Chsy1Q6ZQ11 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Chsy1Q6ZQ11 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Chsy1Q6ZQ11 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Chsy1Q6ZQ11 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Chsy1Q6ZQ11 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Chsy1Q6ZQ11 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Chsy1Q6ZQ11 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Chsy1Q6ZQ11 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Chsy1Q6ZQ11 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Chsy1Q6ZQ11 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Chsy1Q6ZQ11 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Chsy1Q6ZQ11 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Chsy1Q6ZQ11 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Chsy1Q6ZQ11 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Chsy1Q6ZQ11 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Chsy1Q6ZQ11 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Chsy1Q6ZQ11 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Chsy1Q6ZQ11 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Chsy1Q6ZQ11 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Chsy1Q6ZQ11 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Chsy1Q6ZQ11 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Chsy1Q6ZQ11 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Chsy1Q6ZQ11 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Chsy1Q6ZQ11 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Chsy1Q6ZQ11 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
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