Protein–RNA interactions for Protein: Q6PG16

Hjurp, Holliday junction recognition protein, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HjurpQ6PG16 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HjurpQ6PG16 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HjurpQ6PG16 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HjurpQ6PG16 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HjurpQ6PG16 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HjurpQ6PG16 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HjurpQ6PG16 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HjurpQ6PG16 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HjurpQ6PG16 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HjurpQ6PG16 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HjurpQ6PG16 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HjurpQ6PG16 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HjurpQ6PG16 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HjurpQ6PG16 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HjurpQ6PG16 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HjurpQ6PG16 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HjurpQ6PG16 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
HjurpQ6PG16 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HjurpQ6PG16 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
HjurpQ6PG16 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HjurpQ6PG16 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
HjurpQ6PG16 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HjurpQ6PG16 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HjurpQ6PG16 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HjurpQ6PG16 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HjurpQ6PG16 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HjurpQ6PG16 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HjurpQ6PG16 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HjurpQ6PG16 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HjurpQ6PG16 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HjurpQ6PG16 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HjurpQ6PG16 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HjurpQ6PG16 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HjurpQ6PG16 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HjurpQ6PG16 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HjurpQ6PG16 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HjurpQ6PG16 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HjurpQ6PG16 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HjurpQ6PG16 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HjurpQ6PG16 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HjurpQ6PG16 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HjurpQ6PG16 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HjurpQ6PG16 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HjurpQ6PG16 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HjurpQ6PG16 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HjurpQ6PG16 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HjurpQ6PG16 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
HjurpQ6PG16 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HjurpQ6PG16 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HjurpQ6PG16 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HjurpQ6PG16 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HjurpQ6PG16 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HjurpQ6PG16 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HjurpQ6PG16 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HjurpQ6PG16 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HjurpQ6PG16 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HjurpQ6PG16 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HjurpQ6PG16 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
HjurpQ6PG16 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HjurpQ6PG16 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HjurpQ6PG16 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HjurpQ6PG16 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HjurpQ6PG16 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
HjurpQ6PG16 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
HjurpQ6PG16 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HjurpQ6PG16 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HjurpQ6PG16 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HjurpQ6PG16 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
HjurpQ6PG16 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
HjurpQ6PG16 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HjurpQ6PG16 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HjurpQ6PG16 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HjurpQ6PG16 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HjurpQ6PG16 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HjurpQ6PG16 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HjurpQ6PG16 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HjurpQ6PG16 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HjurpQ6PG16 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HjurpQ6PG16 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HjurpQ6PG16 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HjurpQ6PG16 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HjurpQ6PG16 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HjurpQ6PG16 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HjurpQ6PG16 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HjurpQ6PG16 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HjurpQ6PG16 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HjurpQ6PG16 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HjurpQ6PG16 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HjurpQ6PG16 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HjurpQ6PG16 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HjurpQ6PG16 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.07
HjurpQ6PG16 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HjurpQ6PG16 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HjurpQ6PG16 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HjurpQ6PG16 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HjurpQ6PG16 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HjurpQ6PG16 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HjurpQ6PG16 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HjurpQ6PG16 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HjurpQ6PG16 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.8 ms