Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX4

Krt39, Keratin, type I cytoskeletal 39, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt39Q6IFX4 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Krt39Q6IFX4 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Krt39Q6IFX4 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Krt39Q6IFX4 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Krt39Q6IFX4 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Krt39Q6IFX4 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Krt39Q6IFX4 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Krt39Q6IFX4 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Krt39Q6IFX4 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Krt39Q6IFX4 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Krt39Q6IFX4 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Krt39Q6IFX4 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Krt39Q6IFX4 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Krt39Q6IFX4 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Krt39Q6IFX4 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Krt39Q6IFX4 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Krt39Q6IFX4 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Krt39Q6IFX4 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Krt39Q6IFX4 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Krt39Q6IFX4 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Krt39Q6IFX4 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Krt39Q6IFX4 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Krt39Q6IFX4 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Krt39Q6IFX4 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Krt39Q6IFX4 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Krt39Q6IFX4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Krt39Q6IFX4 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Krt39Q6IFX4 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Krt39Q6IFX4 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Krt39Q6IFX4 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Krt39Q6IFX4 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Krt39Q6IFX4 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Krt39Q6IFX4 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Krt39Q6IFX4 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Krt39Q6IFX4 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Krt39Q6IFX4 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Krt39Q6IFX4 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Krt39Q6IFX4 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Krt39Q6IFX4 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Krt39Q6IFX4 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Krt39Q6IFX4 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Krt39Q6IFX4 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Krt39Q6IFX4 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Krt39Q6IFX4 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Krt39Q6IFX4 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Krt39Q6IFX4 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Krt39Q6IFX4 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Krt39Q6IFX4 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Krt39Q6IFX4 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Krt39Q6IFX4 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Krt39Q6IFX4 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Krt39Q6IFX4 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Krt39Q6IFX4 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Krt39Q6IFX4 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Krt39Q6IFX4 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Krt39Q6IFX4 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Krt39Q6IFX4 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Krt39Q6IFX4 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Krt39Q6IFX4 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Krt39Q6IFX4 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Krt39Q6IFX4 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Krt39Q6IFX4 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Krt39Q6IFX4 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Krt39Q6IFX4 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Krt39Q6IFX4 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Krt39Q6IFX4 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Krt39Q6IFX4 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Krt39Q6IFX4 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Krt39Q6IFX4 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Krt39Q6IFX4 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Krt39Q6IFX4 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Krt39Q6IFX4 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Krt39Q6IFX4 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Krt39Q6IFX4 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Krt39Q6IFX4 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Krt39Q6IFX4 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Krt39Q6IFX4 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Krt39Q6IFX4 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Krt39Q6IFX4 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Krt39Q6IFX4 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Krt39Q6IFX4 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Krt39Q6IFX4 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Krt39Q6IFX4 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Krt39Q6IFX4 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Krt39Q6IFX4 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Krt39Q6IFX4 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Krt39Q6IFX4 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Krt39Q6IFX4 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Krt39Q6IFX4 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Krt39Q6IFX4 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Krt39Q6IFX4 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Krt39Q6IFX4 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Krt39Q6IFX4 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Krt39Q6IFX4 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Krt39Q6IFX4 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Krt39Q6IFX4 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Krt39Q6IFX4 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Krt39Q6IFX4 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Krt39Q6IFX4 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Krt39Q6IFX4 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms