Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX2

Krt42, Keratin, type I cytoskeletal 42, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt42Q6IFX2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Krt42Q6IFX2 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Krt42Q6IFX2 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Krt42Q6IFX2 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Krt42Q6IFX2 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Krt42Q6IFX2 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Krt42Q6IFX2 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Krt42Q6IFX2 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Krt42Q6IFX2 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Krt42Q6IFX2 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Krt42Q6IFX2 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Krt42Q6IFX2 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Krt42Q6IFX2 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Krt42Q6IFX2 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Krt42Q6IFX2 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Krt42Q6IFX2 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Krt42Q6IFX2 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Krt42Q6IFX2 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Krt42Q6IFX2 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Krt42Q6IFX2 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Krt42Q6IFX2 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Krt42Q6IFX2 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Krt42Q6IFX2 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Krt42Q6IFX2 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Krt42Q6IFX2 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Krt42Q6IFX2 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Krt42Q6IFX2 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Krt42Q6IFX2 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Krt42Q6IFX2 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Krt42Q6IFX2 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Krt42Q6IFX2 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Krt42Q6IFX2 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Krt42Q6IFX2 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Krt42Q6IFX2 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Krt42Q6IFX2 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Krt42Q6IFX2 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Krt42Q6IFX2 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Krt42Q6IFX2 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Krt42Q6IFX2 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Krt42Q6IFX2 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Krt42Q6IFX2 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Krt42Q6IFX2 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Krt42Q6IFX2 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Krt42Q6IFX2 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Krt42Q6IFX2 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Krt42Q6IFX2 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Krt42Q6IFX2 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Krt42Q6IFX2 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Krt42Q6IFX2 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Krt42Q6IFX2 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Krt42Q6IFX2 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Krt42Q6IFX2 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Krt42Q6IFX2 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Krt42Q6IFX2 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Krt42Q6IFX2 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Krt42Q6IFX2 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Krt42Q6IFX2 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Krt42Q6IFX2 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Krt42Q6IFX2 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Krt42Q6IFX2 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Krt42Q6IFX2 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Krt42Q6IFX2 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Krt42Q6IFX2 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Krt42Q6IFX2 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Krt42Q6IFX2 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Krt42Q6IFX2 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Krt42Q6IFX2 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Krt42Q6IFX2 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Krt42Q6IFX2 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Krt42Q6IFX2 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Krt42Q6IFX2 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Krt42Q6IFX2 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Krt42Q6IFX2 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Krt42Q6IFX2 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Krt42Q6IFX2 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Krt42Q6IFX2 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Krt42Q6IFX2 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Krt42Q6IFX2 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Krt42Q6IFX2 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Krt42Q6IFX2 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Krt42Q6IFX2 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Krt42Q6IFX2 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Krt42Q6IFX2 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Krt42Q6IFX2 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Krt42Q6IFX2 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Krt42Q6IFX2 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Krt42Q6IFX2 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Krt42Q6IFX2 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Krt42Q6IFX2 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Krt42Q6IFX2 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Krt42Q6IFX2 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Krt42Q6IFX2 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Krt42Q6IFX2 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Krt42Q6IFX2 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Krt42Q6IFX2 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Krt42Q6IFX2 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Krt42Q6IFX2 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Krt42Q6IFX2 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Krt42Q6IFX2 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Krt42Q6IFX2 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms