Protein–RNA interactions for Protein: Q64704

Stx3, Syntaxin-3, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx3Q64704 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Stx3Q64704 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Stx3Q64704 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Stx3Q64704 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Stx3Q64704 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Stx3Q64704 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Stx3Q64704 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Stx3Q64704 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Stx3Q64704 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Stx3Q64704 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Stx3Q64704 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Stx3Q64704 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Stx3Q64704 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Stx3Q64704 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Stx3Q64704 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Stx3Q64704 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Stx3Q64704 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Stx3Q64704 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Stx3Q64704 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Stx3Q64704 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Stx3Q64704 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Stx3Q64704 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Stx3Q64704 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Stx3Q64704 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Stx3Q64704 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Stx3Q64704 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Stx3Q64704 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Stx3Q64704 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Stx3Q64704 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Stx3Q64704 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Stx3Q64704 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Stx3Q64704 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Stx3Q64704 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Stx3Q64704 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Stx3Q64704 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Stx3Q64704 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Stx3Q64704 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Stx3Q64704 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Stx3Q64704 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Stx3Q64704 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Stx3Q64704 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Stx3Q64704 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Stx3Q64704 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Stx3Q64704 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Stx3Q64704 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Stx3Q64704 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Stx3Q64704 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Stx3Q64704 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Stx3Q64704 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Stx3Q64704 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Stx3Q64704 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Stx3Q64704 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Stx3Q64704 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Stx3Q64704 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Stx3Q64704 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Stx3Q64704 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Stx3Q64704 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Stx3Q64704 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Stx3Q64704 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Stx3Q64704 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Stx3Q64704 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Stx3Q64704 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Stx3Q64704 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Stx3Q64704 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Stx3Q64704 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Stx3Q64704 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Stx3Q64704 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Stx3Q64704 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Stx3Q64704 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Stx3Q64704 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Stx3Q64704 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Stx3Q64704 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Stx3Q64704 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Stx3Q64704 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Stx3Q64704 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Stx3Q64704 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Stx3Q64704 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Stx3Q64704 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Stx3Q64704 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Stx3Q64704 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Stx3Q64704 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Stx3Q64704 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Stx3Q64704 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Stx3Q64704 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Stx3Q64704 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Stx3Q64704 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Stx3Q64704 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Stx3Q64704 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Stx3Q64704 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Stx3Q64704 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Stx3Q64704 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Stx3Q64704 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Stx3Q64704 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Stx3Q64704 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Stx3Q64704 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Stx3Q64704 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Stx3Q64704 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Stx3Q64704 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Stx3Q64704 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Stx3Q64704 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67 ms