Protein–RNA interactions for Protein: Q61183

Papola, Poly(A) polymerase alpha, mousemouse

Predictions only

Length 739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PapolaQ61183 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PapolaQ61183 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PapolaQ61183 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PapolaQ61183 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PapolaQ61183 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PapolaQ61183 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PapolaQ61183 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PapolaQ61183 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PapolaQ61183 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PapolaQ61183 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PapolaQ61183 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PapolaQ61183 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PapolaQ61183 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PapolaQ61183 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PapolaQ61183 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PapolaQ61183 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PapolaQ61183 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PapolaQ61183 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PapolaQ61183 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PapolaQ61183 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PapolaQ61183 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PapolaQ61183 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PapolaQ61183 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PapolaQ61183 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PapolaQ61183 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PapolaQ61183 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PapolaQ61183 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PapolaQ61183 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PapolaQ61183 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PapolaQ61183 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PapolaQ61183 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PapolaQ61183 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PapolaQ61183 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PapolaQ61183 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PapolaQ61183 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PapolaQ61183 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PapolaQ61183 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PapolaQ61183 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PapolaQ61183 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PapolaQ61183 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PapolaQ61183 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PapolaQ61183 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PapolaQ61183 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PapolaQ61183 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PapolaQ61183 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PapolaQ61183 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PapolaQ61183 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PapolaQ61183 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PapolaQ61183 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PapolaQ61183 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PapolaQ61183 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PapolaQ61183 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PapolaQ61183 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PapolaQ61183 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PapolaQ61183 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PapolaQ61183 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PapolaQ61183 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PapolaQ61183 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PapolaQ61183 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PapolaQ61183 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PapolaQ61183 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PapolaQ61183 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PapolaQ61183 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PapolaQ61183 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PapolaQ61183 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PapolaQ61183 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PapolaQ61183 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PapolaQ61183 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PapolaQ61183 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PapolaQ61183 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PapolaQ61183 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PapolaQ61183 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PapolaQ61183 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PapolaQ61183 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PapolaQ61183 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PapolaQ61183 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PapolaQ61183 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PapolaQ61183 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PapolaQ61183 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PapolaQ61183 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PapolaQ61183 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PapolaQ61183 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PapolaQ61183 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PapolaQ61183 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PapolaQ61183 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PapolaQ61183 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PapolaQ61183 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PapolaQ61183 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PapolaQ61183 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PapolaQ61183 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PapolaQ61183 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PapolaQ61183 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PapolaQ61183 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PapolaQ61183 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PapolaQ61183 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PapolaQ61183 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PapolaQ61183 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PapolaQ61183 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PapolaQ61183 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PapolaQ61183 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms