Protein–RNA interactions for Protein: Q60925

Dbp, D site-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DbpQ60925 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DbpQ60925 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DbpQ60925 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DbpQ60925 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DbpQ60925 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DbpQ60925 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DbpQ60925 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DbpQ60925 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DbpQ60925 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DbpQ60925 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DbpQ60925 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DbpQ60925 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DbpQ60925 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DbpQ60925 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DbpQ60925 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DbpQ60925 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DbpQ60925 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DbpQ60925 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DbpQ60925 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DbpQ60925 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DbpQ60925 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DbpQ60925 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DbpQ60925 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DbpQ60925 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DbpQ60925 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DbpQ60925 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
DbpQ60925 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
DbpQ60925 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
DbpQ60925 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
DbpQ60925 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
DbpQ60925 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
DbpQ60925 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
DbpQ60925 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
DbpQ60925 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
DbpQ60925 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
DbpQ60925 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
DbpQ60925 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
DbpQ60925 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
DbpQ60925 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
DbpQ60925 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DbpQ60925 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
DbpQ60925 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
DbpQ60925 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
DbpQ60925 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DbpQ60925 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DbpQ60925 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DbpQ60925 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DbpQ60925 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DbpQ60925 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DbpQ60925 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DbpQ60925 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
DbpQ60925 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DbpQ60925 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DbpQ60925 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DbpQ60925 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
DbpQ60925 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DbpQ60925 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DbpQ60925 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
DbpQ60925 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
DbpQ60925 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DbpQ60925 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DbpQ60925 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DbpQ60925 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DbpQ60925 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DbpQ60925 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DbpQ60925 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DbpQ60925 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DbpQ60925 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DbpQ60925 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DbpQ60925 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DbpQ60925 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DbpQ60925 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DbpQ60925 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DbpQ60925 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DbpQ60925 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DbpQ60925 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DbpQ60925 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DbpQ60925 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DbpQ60925 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DbpQ60925 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DbpQ60925 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DbpQ60925 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DbpQ60925 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DbpQ60925 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DbpQ60925 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
DbpQ60925 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DbpQ60925 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DbpQ60925 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DbpQ60925 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DbpQ60925 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
DbpQ60925 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
DbpQ60925 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DbpQ60925 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DbpQ60925 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DbpQ60925 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DbpQ60925 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DbpQ60925 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DbpQ60925 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DbpQ60925 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DbpQ60925 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms