Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTK1

Chsy3, Chondroitin sulfate synthase 3, mousemouse

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Length 884 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chsy3Q5DTK1 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Chsy3Q5DTK1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chsy3Q5DTK1 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Chsy3Q5DTK1 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Chsy3Q5DTK1 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Chsy3Q5DTK1 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Chsy3Q5DTK1 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chsy3Q5DTK1 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chsy3Q5DTK1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chsy3Q5DTK1 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chsy3Q5DTK1 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chsy3Q5DTK1 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Chsy3Q5DTK1 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Chsy3Q5DTK1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Chsy3Q5DTK1 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Chsy3Q5DTK1 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Chsy3Q5DTK1 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Chsy3Q5DTK1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Chsy3Q5DTK1 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chsy3Q5DTK1 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chsy3Q5DTK1 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chsy3Q5DTK1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chsy3Q5DTK1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chsy3Q5DTK1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Chsy3Q5DTK1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chsy3Q5DTK1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chsy3Q5DTK1 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chsy3Q5DTK1 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chsy3Q5DTK1 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Chsy3Q5DTK1 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Chsy3Q5DTK1 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Chsy3Q5DTK1 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Chsy3Q5DTK1 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Chsy3Q5DTK1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Chsy3Q5DTK1 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Chsy3Q5DTK1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Chsy3Q5DTK1 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Chsy3Q5DTK1 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Chsy3Q5DTK1 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Chsy3Q5DTK1 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Chsy3Q5DTK1 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Chsy3Q5DTK1 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Chsy3Q5DTK1 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Chsy3Q5DTK1 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Chsy3Q5DTK1 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Chsy3Q5DTK1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chsy3Q5DTK1 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chsy3Q5DTK1 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chsy3Q5DTK1 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chsy3Q5DTK1 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Chsy3Q5DTK1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chsy3Q5DTK1 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chsy3Q5DTK1 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chsy3Q5DTK1 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chsy3Q5DTK1 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chsy3Q5DTK1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chsy3Q5DTK1 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chsy3Q5DTK1 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chsy3Q5DTK1 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chsy3Q5DTK1 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chsy3Q5DTK1 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chsy3Q5DTK1 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chsy3Q5DTK1 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chsy3Q5DTK1 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chsy3Q5DTK1 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chsy3Q5DTK1 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Chsy3Q5DTK1 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Chsy3Q5DTK1 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chsy3Q5DTK1 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chsy3Q5DTK1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Chsy3Q5DTK1 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Chsy3Q5DTK1 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chsy3Q5DTK1 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Chsy3Q5DTK1 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Chsy3Q5DTK1 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Chsy3Q5DTK1 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Chsy3Q5DTK1 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Chsy3Q5DTK1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Chsy3Q5DTK1 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Chsy3Q5DTK1 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Chsy3Q5DTK1 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Chsy3Q5DTK1 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Chsy3Q5DTK1 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Chsy3Q5DTK1 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Chsy3Q5DTK1 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Chsy3Q5DTK1 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Chsy3Q5DTK1 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Chsy3Q5DTK1 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Chsy3Q5DTK1 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Chsy3Q5DTK1 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Chsy3Q5DTK1 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Chsy3Q5DTK1 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Chsy3Q5DTK1 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Chsy3Q5DTK1 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Chsy3Q5DTK1 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Chsy3Q5DTK1 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Chsy3Q5DTK1 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Chsy3Q5DTK1 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Chsy3Q5DTK1 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Chsy3Q5DTK1 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
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