Protein–RNA interactions for Protein: Q3V209

Tmub2, Transmembrane and ubiquitin-like domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmub2Q3V209 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmub2Q3V209 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmub2Q3V209 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmub2Q3V209 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmub2Q3V209 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmub2Q3V209 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmub2Q3V209 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tmub2Q3V209 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tmub2Q3V209 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tmub2Q3V209 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmub2Q3V209 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmub2Q3V209 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmub2Q3V209 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmub2Q3V209 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmub2Q3V209 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmub2Q3V209 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmub2Q3V209 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmub2Q3V209 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmub2Q3V209 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmub2Q3V209 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmub2Q3V209 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmub2Q3V209 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmub2Q3V209 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmub2Q3V209 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmub2Q3V209 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmub2Q3V209 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmub2Q3V209 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmub2Q3V209 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmub2Q3V209 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmub2Q3V209 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmub2Q3V209 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmub2Q3V209 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmub2Q3V209 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmub2Q3V209 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmub2Q3V209 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmub2Q3V209 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmub2Q3V209 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tmub2Q3V209 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tmub2Q3V209 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tmub2Q3V209 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tmub2Q3V209 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tmub2Q3V209 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tmub2Q3V209 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tmub2Q3V209 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tmub2Q3V209 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tmub2Q3V209 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tmub2Q3V209 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Tmub2Q3V209 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tmub2Q3V209 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Tmub2Q3V209 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tmub2Q3V209 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Tmub2Q3V209 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tmub2Q3V209 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tmub2Q3V209 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tmub2Q3V209 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tmub2Q3V209 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tmub2Q3V209 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tmub2Q3V209 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tmub2Q3V209 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tmub2Q3V209 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tmub2Q3V209 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tmub2Q3V209 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tmub2Q3V209 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tmub2Q3V209 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tmub2Q3V209 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tmub2Q3V209 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tmub2Q3V209 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tmub2Q3V209 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tmub2Q3V209 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tmub2Q3V209 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tmub2Q3V209 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tmub2Q3V209 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tmub2Q3V209 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tmub2Q3V209 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tmub2Q3V209 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tmub2Q3V209 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tmub2Q3V209 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tmub2Q3V209 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tmub2Q3V209 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tmub2Q3V209 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tmub2Q3V209 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tmub2Q3V209 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tmub2Q3V209 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tmub2Q3V209 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tmub2Q3V209 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Tmub2Q3V209 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tmub2Q3V209 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tmub2Q3V209 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tmub2Q3V209 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tmub2Q3V209 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tmub2Q3V209 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tmub2Q3V209 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tmub2Q3V209 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tmub2Q3V209 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Tmub2Q3V209 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tmub2Q3V209 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tmub2Q3V209 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tmub2Q3V209 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tmub2Q3V209 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tmub2Q3V209 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms