Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW77

Gm12888, MCG59630, mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm12888Q3UW77 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm12888Q3UW77 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm12888Q3UW77 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm12888Q3UW77 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm12888Q3UW77 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm12888Q3UW77 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm12888Q3UW77 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm12888Q3UW77 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm12888Q3UW77 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm12888Q3UW77 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm12888Q3UW77 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm12888Q3UW77 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm12888Q3UW77 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm12888Q3UW77 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm12888Q3UW77 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm12888Q3UW77 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm12888Q3UW77 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm12888Q3UW77 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm12888Q3UW77 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm12888Q3UW77 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm12888Q3UW77 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm12888Q3UW77 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm12888Q3UW77 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm12888Q3UW77 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm12888Q3UW77 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm12888Q3UW77 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm12888Q3UW77 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm12888Q3UW77 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm12888Q3UW77 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm12888Q3UW77 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm12888Q3UW77 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm12888Q3UW77 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm12888Q3UW77 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm12888Q3UW77 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm12888Q3UW77 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm12888Q3UW77 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm12888Q3UW77 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm12888Q3UW77 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm12888Q3UW77 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm12888Q3UW77 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm12888Q3UW77 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm12888Q3UW77 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm12888Q3UW77 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm12888Q3UW77 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm12888Q3UW77 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm12888Q3UW77 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm12888Q3UW77 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm12888Q3UW77 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm12888Q3UW77 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm12888Q3UW77 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm12888Q3UW77 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm12888Q3UW77 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm12888Q3UW77 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm12888Q3UW77 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm12888Q3UW77 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm12888Q3UW77 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm12888Q3UW77 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm12888Q3UW77 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm12888Q3UW77 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm12888Q3UW77 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm12888Q3UW77 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm12888Q3UW77 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm12888Q3UW77 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm12888Q3UW77 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm12888Q3UW77 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm12888Q3UW77 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm12888Q3UW77 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm12888Q3UW77 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm12888Q3UW77 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm12888Q3UW77 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm12888Q3UW77 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm12888Q3UW77 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm12888Q3UW77 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm12888Q3UW77 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm12888Q3UW77 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm12888Q3UW77 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm12888Q3UW77 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm12888Q3UW77 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm12888Q3UW77 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm12888Q3UW77 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm12888Q3UW77 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm12888Q3UW77 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm12888Q3UW77 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm12888Q3UW77 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm12888Q3UW77 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm12888Q3UW77 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm12888Q3UW77 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm12888Q3UW77 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm12888Q3UW77 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm12888Q3UW77 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm12888Q3UW77 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm12888Q3UW77 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm12888Q3UW77 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm12888Q3UW77 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm12888Q3UW77 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm12888Q3UW77 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm12888Q3UW77 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm12888Q3UW77 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm12888Q3UW77 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm12888Q3UW77 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 174.9 ms