Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFB7

Ntrk1, High affinity nerve growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 799 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntrk1Q3UFB7 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ntrk1Q3UFB7 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ntrk1Q3UFB7 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Ntrk1Q3UFB7 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ntrk1Q3UFB7 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ntrk1Q3UFB7 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ntrk1Q3UFB7 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ntrk1Q3UFB7 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ntrk1Q3UFB7 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ntrk1Q3UFB7 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ntrk1Q3UFB7 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ntrk1Q3UFB7 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ntrk1Q3UFB7 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ntrk1Q3UFB7 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ntrk1Q3UFB7 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ntrk1Q3UFB7 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ntrk1Q3UFB7 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ntrk1Q3UFB7 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ntrk1Q3UFB7 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ntrk1Q3UFB7 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ntrk1Q3UFB7 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ntrk1Q3UFB7 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Ntrk1Q3UFB7 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ntrk1Q3UFB7 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ntrk1Q3UFB7 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ntrk1Q3UFB7 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ntrk1Q3UFB7 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ntrk1Q3UFB7 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ntrk1Q3UFB7 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ntrk1Q3UFB7 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ntrk1Q3UFB7 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ntrk1Q3UFB7 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ntrk1Q3UFB7 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ntrk1Q3UFB7 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ntrk1Q3UFB7 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Ntrk1Q3UFB7 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ntrk1Q3UFB7 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ntrk1Q3UFB7 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ntrk1Q3UFB7 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ntrk1Q3UFB7 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ntrk1Q3UFB7 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ntrk1Q3UFB7 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ntrk1Q3UFB7 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ntrk1Q3UFB7 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ntrk1Q3UFB7 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ntrk1Q3UFB7 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ntrk1Q3UFB7 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ntrk1Q3UFB7 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ntrk1Q3UFB7 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ntrk1Q3UFB7 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ntrk1Q3UFB7 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ntrk1Q3UFB7 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ntrk1Q3UFB7 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ntrk1Q3UFB7 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ntrk1Q3UFB7 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ntrk1Q3UFB7 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ntrk1Q3UFB7 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ntrk1Q3UFB7 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ntrk1Q3UFB7 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ntrk1Q3UFB7 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ntrk1Q3UFB7 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ntrk1Q3UFB7 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ntrk1Q3UFB7 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ntrk1Q3UFB7 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ntrk1Q3UFB7 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ntrk1Q3UFB7 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ntrk1Q3UFB7 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ntrk1Q3UFB7 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ntrk1Q3UFB7 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ntrk1Q3UFB7 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Ntrk1Q3UFB7 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Ntrk1Q3UFB7 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ntrk1Q3UFB7 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ntrk1Q3UFB7 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ntrk1Q3UFB7 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ntrk1Q3UFB7 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ntrk1Q3UFB7 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ntrk1Q3UFB7 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ntrk1Q3UFB7 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ntrk1Q3UFB7 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ntrk1Q3UFB7 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ntrk1Q3UFB7 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ntrk1Q3UFB7 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ntrk1Q3UFB7 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ntrk1Q3UFB7 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ntrk1Q3UFB7 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ntrk1Q3UFB7 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ntrk1Q3UFB7 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ntrk1Q3UFB7 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ntrk1Q3UFB7 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ntrk1Q3UFB7 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Ntrk1Q3UFB7 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ntrk1Q3UFB7 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ntrk1Q3UFB7 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ntrk1Q3UFB7 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ntrk1Q3UFB7 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ntrk1Q3UFB7 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ntrk1Q3UFB7 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ntrk1Q3UFB7 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ntrk1Q3UFB7 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms