Protein–RNA interactions for Protein: Q3U827

Rnf180, E3 ubiquitin-protein ligase RNF180, mousemouse

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf180Q3U827 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Rnf180Q3U827 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Rnf180Q3U827 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Rnf180Q3U827 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rnf180Q3U827 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Rnf180Q3U827 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rnf180Q3U827 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rnf180Q3U827 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rnf180Q3U827 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rnf180Q3U827 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rnf180Q3U827 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Rnf180Q3U827 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Rnf180Q3U827 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Rnf180Q3U827 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Rnf180Q3U827 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
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Rnf180Q3U827 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rnf180Q3U827 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rnf180Q3U827 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rnf180Q3U827 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rnf180Q3U827 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Rnf180Q3U827 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Rnf180Q3U827 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Rnf180Q3U827 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Rnf180Q3U827 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Rnf180Q3U827 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Rnf180Q3U827 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Rnf180Q3U827 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
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Rnf180Q3U827 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Rnf180Q3U827 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Rnf180Q3U827 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Rnf180Q3U827 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Rnf180Q3U827 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Rnf180Q3U827 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Rnf180Q3U827 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Rnf180Q3U827 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Rnf180Q3U827 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Rnf180Q3U827 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Rnf180Q3U827 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
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Rnf180Q3U827 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
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Rnf180Q3U827 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Rnf180Q3U827 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
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Rnf180Q3U827 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
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Rnf180Q3U827 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rnf180Q3U827 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
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Rnf180Q3U827 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rnf180Q3U827 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
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Rnf180Q3U827 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rnf180Q3U827 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rnf180Q3U827 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Rnf180Q3U827 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Rnf180Q3U827 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Rnf180Q3U827 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Rnf180Q3U827 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Rnf180Q3U827 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rnf180Q3U827 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rnf180Q3U827 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rnf180Q3U827 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rnf180Q3U827 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Rnf180Q3U827 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rnf180Q3U827 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rnf180Q3U827 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rnf180Q3U827 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Rnf180Q3U827 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rnf180Q3U827 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rnf180Q3U827 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rnf180Q3U827 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Rnf180Q3U827 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Rnf180Q3U827 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rnf180Q3U827 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rnf180Q3U827 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
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