Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYU2

Atp13a5, Probable cation-transporting ATPase 13A5, mousemouse

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a5Q3TYU2 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atp13a5Q3TYU2 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Atp13a5Q3TYU2 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atp13a5Q3TYU2 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atp13a5Q3TYU2 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atp13a5Q3TYU2 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atp13a5Q3TYU2 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atp13a5Q3TYU2 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atp13a5Q3TYU2 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atp13a5Q3TYU2 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atp13a5Q3TYU2 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atp13a5Q3TYU2 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atp13a5Q3TYU2 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atp13a5Q3TYU2 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atp13a5Q3TYU2 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atp13a5Q3TYU2 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atp13a5Q3TYU2 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atp13a5Q3TYU2 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atp13a5Q3TYU2 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atp13a5Q3TYU2 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atp13a5Q3TYU2 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atp13a5Q3TYU2 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atp13a5Q3TYU2 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atp13a5Q3TYU2 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atp13a5Q3TYU2 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atp13a5Q3TYU2 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atp13a5Q3TYU2 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Atp13a5Q3TYU2 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atp13a5Q3TYU2 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atp13a5Q3TYU2 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atp13a5Q3TYU2 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atp13a5Q3TYU2 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atp13a5Q3TYU2 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atp13a5Q3TYU2 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atp13a5Q3TYU2 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atp13a5Q3TYU2 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atp13a5Q3TYU2 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atp13a5Q3TYU2 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atp13a5Q3TYU2 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Atp13a5Q3TYU2 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atp13a5Q3TYU2 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atp13a5Q3TYU2 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atp13a5Q3TYU2 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atp13a5Q3TYU2 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atp13a5Q3TYU2 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atp13a5Q3TYU2 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atp13a5Q3TYU2 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atp13a5Q3TYU2 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atp13a5Q3TYU2 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atp13a5Q3TYU2 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atp13a5Q3TYU2 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atp13a5Q3TYU2 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atp13a5Q3TYU2 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atp13a5Q3TYU2 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atp13a5Q3TYU2 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atp13a5Q3TYU2 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atp13a5Q3TYU2 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atp13a5Q3TYU2 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atp13a5Q3TYU2 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atp13a5Q3TYU2 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atp13a5Q3TYU2 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atp13a5Q3TYU2 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atp13a5Q3TYU2 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atp13a5Q3TYU2 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atp13a5Q3TYU2 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atp13a5Q3TYU2 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atp13a5Q3TYU2 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atp13a5Q3TYU2 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atp13a5Q3TYU2 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atp13a5Q3TYU2 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atp13a5Q3TYU2 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atp13a5Q3TYU2 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atp13a5Q3TYU2 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atp13a5Q3TYU2 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atp13a5Q3TYU2 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atp13a5Q3TYU2 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atp13a5Q3TYU2 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atp13a5Q3TYU2 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atp13a5Q3TYU2 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atp13a5Q3TYU2 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atp13a5Q3TYU2 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atp13a5Q3TYU2 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atp13a5Q3TYU2 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atp13a5Q3TYU2 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atp13a5Q3TYU2 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atp13a5Q3TYU2 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atp13a5Q3TYU2 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atp13a5Q3TYU2 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atp13a5Q3TYU2 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atp13a5Q3TYU2 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Atp13a5Q3TYU2 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Atp13a5Q3TYU2 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Atp13a5Q3TYU2 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atp13a5Q3TYU2 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atp13a5Q3TYU2 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atp13a5Q3TYU2 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atp13a5Q3TYU2 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atp13a5Q3TYU2 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atp13a5Q3TYU2 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Atp13a5Q3TYU2 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms