Protein–RNA interactions for Protein: Q0GGX2

Znf541, Zinc finger protein 541, mousemouse

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf541Q0GGX2 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Znf541Q0GGX2 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
Znf541Q0GGX2 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Znf541Q0GGX2 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Znf541Q0GGX2 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Znf541Q0GGX2 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Znf541Q0GGX2 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Znf541Q0GGX2 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Znf541Q0GGX2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Znf541Q0GGX2 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Znf541Q0GGX2 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Znf541Q0GGX2 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Znf541Q0GGX2 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Znf541Q0GGX2 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Znf541Q0GGX2 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Znf541Q0GGX2 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Znf541Q0GGX2 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.29
Znf541Q0GGX2 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Znf541Q0GGX2 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Znf541Q0GGX2 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Znf541Q0GGX2 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Znf541Q0GGX2 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
Znf541Q0GGX2 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
Znf541Q0GGX2 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
Znf541Q0GGX2 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Znf541Q0GGX2 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Znf541Q0GGX2 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Znf541Q0GGX2 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Znf541Q0GGX2 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Znf541Q0GGX2 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Znf541Q0GGX2 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Znf541Q0GGX2 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Znf541Q0GGX2 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Znf541Q0GGX2 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Znf541Q0GGX2 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Znf541Q0GGX2 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Znf541Q0GGX2 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Znf541Q0GGX2 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Znf541Q0GGX2 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Znf541Q0GGX2 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Znf541Q0GGX2 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Znf541Q0GGX2 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Znf541Q0GGX2 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Znf541Q0GGX2 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Znf541Q0GGX2 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Znf541Q0GGX2 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Znf541Q0GGX2 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Znf541Q0GGX2 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Znf541Q0GGX2 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Znf541Q0GGX2 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Znf541Q0GGX2 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Znf541Q0GGX2 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Znf541Q0GGX2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Znf541Q0GGX2 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Znf541Q0GGX2 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Znf541Q0GGX2 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Znf541Q0GGX2 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Znf541Q0GGX2 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Znf541Q0GGX2 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Znf541Q0GGX2 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Znf541Q0GGX2 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Znf541Q0GGX2 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Znf541Q0GGX2 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Znf541Q0GGX2 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
Znf541Q0GGX2 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.28
Znf541Q0GGX2 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Znf541Q0GGX2 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Znf541Q0GGX2 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Znf541Q0GGX2 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Znf541Q0GGX2 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Znf541Q0GGX2 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Znf541Q0GGX2 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Znf541Q0GGX2 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Znf541Q0GGX2 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Znf541Q0GGX2 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Znf541Q0GGX2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Znf541Q0GGX2 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Znf541Q0GGX2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Znf541Q0GGX2 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
Znf541Q0GGX2 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Znf541Q0GGX2 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Znf541Q0GGX2 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Znf541Q0GGX2 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
Znf541Q0GGX2 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Znf541Q0GGX2 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Znf541Q0GGX2 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
Znf541Q0GGX2 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Znf541Q0GGX2 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Znf541Q0GGX2 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Znf541Q0GGX2 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Znf541Q0GGX2 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Znf541Q0GGX2 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Znf541Q0GGX2 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Znf541Q0GGX2 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Znf541Q0GGX2 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Znf541Q0GGX2 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Znf541Q0GGX2 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Znf541Q0GGX2 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Znf541Q0GGX2 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Znf541Q0GGX2 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms