Protein–RNA interactions for Protein: Q0GA42

Cnnm1, Metal transporter CNNM1, mousemouse

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnnm1Q0GA42 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Cnnm1Q0GA42 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Cnnm1Q0GA42 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Cnnm1Q0GA42 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Cnnm1Q0GA42 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Cnnm1Q0GA42 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Cnnm1Q0GA42 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Cnnm1Q0GA42 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Cnnm1Q0GA42 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Cnnm1Q0GA42 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Cnnm1Q0GA42 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Cnnm1Q0GA42 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Cnnm1Q0GA42 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Cnnm1Q0GA42 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Cnnm1Q0GA42 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Cnnm1Q0GA42 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Cnnm1Q0GA42 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Cnnm1Q0GA42 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Cnnm1Q0GA42 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Cnnm1Q0GA42 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Cnnm1Q0GA42 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Cnnm1Q0GA42 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Cnnm1Q0GA42 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Cnnm1Q0GA42 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Cnnm1Q0GA42 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Cnnm1Q0GA42 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Cnnm1Q0GA42 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Cnnm1Q0GA42 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Cnnm1Q0GA42 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Cnnm1Q0GA42 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Cnnm1Q0GA42 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Cnnm1Q0GA42 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Cnnm1Q0GA42 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Cnnm1Q0GA42 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Cnnm1Q0GA42 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Cnnm1Q0GA42 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Cnnm1Q0GA42 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Cnnm1Q0GA42 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Cnnm1Q0GA42 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Cnnm1Q0GA42 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Cnnm1Q0GA42 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Cnnm1Q0GA42 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Cnnm1Q0GA42 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Cnnm1Q0GA42 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Cnnm1Q0GA42 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Cnnm1Q0GA42 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Cnnm1Q0GA42 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Cnnm1Q0GA42 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Cnnm1Q0GA42 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Cnnm1Q0GA42 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Cnnm1Q0GA42 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Cnnm1Q0GA42 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Cnnm1Q0GA42 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Cnnm1Q0GA42 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Cnnm1Q0GA42 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Cnnm1Q0GA42 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Cnnm1Q0GA42 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Cnnm1Q0GA42 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Cnnm1Q0GA42 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Cnnm1Q0GA42 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Cnnm1Q0GA42 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Cnnm1Q0GA42 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Cnnm1Q0GA42 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Cnnm1Q0GA42 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Cnnm1Q0GA42 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Cnnm1Q0GA42 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Cnnm1Q0GA42 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Cnnm1Q0GA42 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Cnnm1Q0GA42 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Cnnm1Q0GA42 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Cnnm1Q0GA42 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Cnnm1Q0GA42 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Cnnm1Q0GA42 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.16
Cnnm1Q0GA42 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Cnnm1Q0GA42 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Cnnm1Q0GA42 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Cnnm1Q0GA42 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Cnnm1Q0GA42 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Cnnm1Q0GA42 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Cnnm1Q0GA42 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Cnnm1Q0GA42 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Cnnm1Q0GA42 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Cnnm1Q0GA42 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Cnnm1Q0GA42 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Cnnm1Q0GA42 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Cnnm1Q0GA42 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Cnnm1Q0GA42 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Cnnm1Q0GA42 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Cnnm1Q0GA42 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Cnnm1Q0GA42 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Cnnm1Q0GA42 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Cnnm1Q0GA42 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Cnnm1Q0GA42 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Cnnm1Q0GA42 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Cnnm1Q0GA42 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Cnnm1Q0GA42 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Cnnm1Q0GA42 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Cnnm1Q0GA42 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Cnnm1Q0GA42 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Cnnm1Q0GA42 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.2 ms