Protein–RNA interactions for Protein: P97427

Crmp1, Dihydropyrimidinase-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crmp1P97427 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Crmp1P97427 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Crmp1P97427 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Crmp1P97427 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Crmp1P97427 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Crmp1P97427 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Crmp1P97427 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Crmp1P97427 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Crmp1P97427 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Crmp1P97427 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Crmp1P97427 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Crmp1P97427 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Crmp1P97427 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Crmp1P97427 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Crmp1P97427 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Crmp1P97427 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Crmp1P97427 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Crmp1P97427 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Crmp1P97427 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Crmp1P97427 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Crmp1P97427 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Crmp1P97427 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Crmp1P97427 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Crmp1P97427 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Crmp1P97427 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Crmp1P97427 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Crmp1P97427 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Crmp1P97427 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Crmp1P97427 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Crmp1P97427 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Crmp1P97427 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Crmp1P97427 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Crmp1P97427 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Crmp1P97427 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Crmp1P97427 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Crmp1P97427 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Crmp1P97427 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Crmp1P97427 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Crmp1P97427 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Crmp1P97427 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Crmp1P97427 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Crmp1P97427 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Crmp1P97427 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Crmp1P97427 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Crmp1P97427 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Crmp1P97427 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Crmp1P97427 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Crmp1P97427 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Crmp1P97427 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Crmp1P97427 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Crmp1P97427 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Crmp1P97427 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Crmp1P97427 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Crmp1P97427 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Crmp1P97427 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Crmp1P97427 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Crmp1P97427 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Crmp1P97427 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Crmp1P97427 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Crmp1P97427 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Crmp1P97427 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Crmp1P97427 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Crmp1P97427 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Crmp1P97427 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Crmp1P97427 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Crmp1P97427 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Crmp1P97427 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Crmp1P97427 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Crmp1P97427 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Crmp1P97427 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Crmp1P97427 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Crmp1P97427 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Crmp1P97427 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Crmp1P97427 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Crmp1P97427 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Crmp1P97427 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Crmp1P97427 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Crmp1P97427 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Crmp1P97427 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Crmp1P97427 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Crmp1P97427 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Crmp1P97427 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Crmp1P97427 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Crmp1P97427 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Crmp1P97427 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Crmp1P97427 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Crmp1P97427 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Crmp1P97427 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Crmp1P97427 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Crmp1P97427 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Crmp1P97427 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Crmp1P97427 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Crmp1P97427 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Crmp1P97427 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Crmp1P97427 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Crmp1P97427 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Crmp1P97427 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Crmp1P97427 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Crmp1P97427 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Crmp1P97427 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms